Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCU6

Mrpl4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl4Q9DCU6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Mrpl4Q9DCU6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Mrpl4Q9DCU6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Mrpl4Q9DCU6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Mrpl4Q9DCU6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Mrpl4Q9DCU6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Mrpl4Q9DCU6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Mrpl4Q9DCU6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Mrpl4Q9DCU6 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Mrpl4Q9DCU6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Mrpl4Q9DCU6 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Mrpl4Q9DCU6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Mrpl4Q9DCU6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Mrpl4Q9DCU6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Mrpl4Q9DCU6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Mrpl4Q9DCU6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Mrpl4Q9DCU6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Mrpl4Q9DCU6 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Mrpl4Q9DCU6 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Mrpl4Q9DCU6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Mrpl4Q9DCU6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Mrpl4Q9DCU6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mrpl4Q9DCU6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mrpl4Q9DCU6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mrpl4Q9DCU6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mrpl4Q9DCU6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mrpl4Q9DCU6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mrpl4Q9DCU6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mrpl4Q9DCU6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mrpl4Q9DCU6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mrpl4Q9DCU6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Mrpl4Q9DCU6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mrpl4Q9DCU6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mrpl4Q9DCU6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mrpl4Q9DCU6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mrpl4Q9DCU6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mrpl4Q9DCU6 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mrpl4Q9DCU6 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Mrpl4Q9DCU6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mrpl4Q9DCU6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mrpl4Q9DCU6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mrpl4Q9DCU6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mrpl4Q9DCU6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mrpl4Q9DCU6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mrpl4Q9DCU6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mrpl4Q9DCU6 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mrpl4Q9DCU6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mrpl4Q9DCU6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mrpl4Q9DCU6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mrpl4Q9DCU6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mrpl4Q9DCU6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mrpl4Q9DCU6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mrpl4Q9DCU6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Mrpl4Q9DCU6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mrpl4Q9DCU6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mrpl4Q9DCU6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mrpl4Q9DCU6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mrpl4Q9DCU6 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mrpl4Q9DCU6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mrpl4Q9DCU6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mrpl4Q9DCU6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mrpl4Q9DCU6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mrpl4Q9DCU6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mrpl4Q9DCU6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mrpl4Q9DCU6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mrpl4Q9DCU6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mrpl4Q9DCU6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mrpl4Q9DCU6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mrpl4Q9DCU6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mrpl4Q9DCU6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mrpl4Q9DCU6 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mrpl4Q9DCU6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mrpl4Q9DCU6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mrpl4Q9DCU6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mrpl4Q9DCU6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mrpl4Q9DCU6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mrpl4Q9DCU6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mrpl4Q9DCU6 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mrpl4Q9DCU6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Mrpl4Q9DCU6 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mrpl4Q9DCU6 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mrpl4Q9DCU6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mrpl4Q9DCU6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mrpl4Q9DCU6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mrpl4Q9DCU6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mrpl4Q9DCU6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mrpl4Q9DCU6 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mrpl4Q9DCU6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Mrpl4Q9DCU6 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Mrpl4Q9DCU6 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Mrpl4Q9DCU6 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Mrpl4Q9DCU6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Mrpl4Q9DCU6 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Mrpl4Q9DCU6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Mrpl4Q9DCU6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Mrpl4Q9DCU6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Mrpl4Q9DCU6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Mrpl4Q9DCU6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Mrpl4Q9DCU6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Mrpl4Q9DCU6 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms