Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf6Q9DBU5 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf6Q9DBU5 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf6Q9DBU5 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf6Q9DBU5 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rnf6Q9DBU5 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rnf6Q9DBU5 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rnf6Q9DBU5 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf6Q9DBU5 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf6Q9DBU5 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf6Q9DBU5 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf6Q9DBU5 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf6Q9DBU5 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf6Q9DBU5 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf6Q9DBU5 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf6Q9DBU5 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf6Q9DBU5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf6Q9DBU5 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf6Q9DBU5 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf6Q9DBU5 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf6Q9DBU5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf6Q9DBU5 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf6Q9DBU5 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf6Q9DBU5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf6Q9DBU5 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf6Q9DBU5 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf6Q9DBU5 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf6Q9DBU5 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf6Q9DBU5 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf6Q9DBU5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf6Q9DBU5 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf6Q9DBU5 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf6Q9DBU5 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf6Q9DBU5 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf6Q9DBU5 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf6Q9DBU5 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf6Q9DBU5 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf6Q9DBU5 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf6Q9DBU5 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf6Q9DBU5 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf6Q9DBU5 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf6Q9DBU5 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf6Q9DBU5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf6Q9DBU5 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf6Q9DBU5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf6Q9DBU5 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf6Q9DBU5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf6Q9DBU5 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf6Q9DBU5 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf6Q9DBU5 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf6Q9DBU5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf6Q9DBU5 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf6Q9DBU5 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf6Q9DBU5 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf6Q9DBU5 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf6Q9DBU5 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf6Q9DBU5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf6Q9DBU5 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf6Q9DBU5 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf6Q9DBU5 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf6Q9DBU5 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf6Q9DBU5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf6Q9DBU5 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf6Q9DBU5 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf6Q9DBU5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf6Q9DBU5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf6Q9DBU5 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf6Q9DBU5 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf6Q9DBU5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf6Q9DBU5 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf6Q9DBU5 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf6Q9DBU5 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnf6Q9DBU5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnf6Q9DBU5 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnf6Q9DBU5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnf6Q9DBU5 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnf6Q9DBU5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnf6Q9DBU5 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnf6Q9DBU5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnf6Q9DBU5 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnf6Q9DBU5 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnf6Q9DBU5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnf6Q9DBU5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnf6Q9DBU5 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnf6Q9DBU5 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rnf6Q9DBU5 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rnf6Q9DBU5 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rnf6Q9DBU5 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rnf6Q9DBU5 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rnf6Q9DBU5 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rnf6Q9DBU5 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rnf6Q9DBU5 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rnf6Q9DBU5 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rnf6Q9DBU5 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rnf6Q9DBU5 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rnf6Q9DBU5 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rnf6Q9DBU5 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rnf6Q9DBU5 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rnf6Q9DBU5 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rnf6Q9DBU5 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms