Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB50

Ap1s2, AP-1 complex subunit sigma-2, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap1s2Q9DB50 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ap1s2Q9DB50 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ap1s2Q9DB50 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ap1s2Q9DB50 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ap1s2Q9DB50 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ap1s2Q9DB50 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ap1s2Q9DB50 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ap1s2Q9DB50 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ap1s2Q9DB50 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ap1s2Q9DB50 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ap1s2Q9DB50 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ap1s2Q9DB50 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ap1s2Q9DB50 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ap1s2Q9DB50 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ap1s2Q9DB50 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ap1s2Q9DB50 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ap1s2Q9DB50 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ap1s2Q9DB50 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ap1s2Q9DB50 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ap1s2Q9DB50 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ap1s2Q9DB50 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap1s2Q9DB50 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms