Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Med27Q9DB40 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Med27Q9DB40 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Med27Q9DB40 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Med27Q9DB40 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Med27Q9DB40 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Med27Q9DB40 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Med27Q9DB40 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Med27Q9DB40 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Med27Q9DB40 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Med27Q9DB40 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Med27Q9DB40 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Med27Q9DB40 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Med27Q9DB40 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Med27Q9DB40 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Med27Q9DB40 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Med27Q9DB40 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Med27Q9DB40 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Med27Q9DB40 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Med27Q9DB40 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Med27Q9DB40 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Med27Q9DB40 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Med27Q9DB40 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Med27Q9DB40 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Med27Q9DB40 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Med27Q9DB40 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Med27Q9DB40 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Med27Q9DB40 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Med27Q9DB40 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Med27Q9DB40 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Med27Q9DB40 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Med27Q9DB40 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Med27Q9DB40 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Med27Q9DB40 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Med27Q9DB40 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Med27Q9DB40 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Med27Q9DB40 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Med27Q9DB40 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Med27Q9DB40 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Med27Q9DB40 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Med27Q9DB40 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Med27Q9DB40 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Med27Q9DB40 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Med27Q9DB40 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Med27Q9DB40 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Med27Q9DB40 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Med27Q9DB40 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Med27Q9DB40 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Med27Q9DB40 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Med27Q9DB40 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Med27Q9DB40 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Med27Q9DB40 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Med27Q9DB40 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Med27Q9DB40 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Med27Q9DB40 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Med27Q9DB40 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Med27Q9DB40 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Med27Q9DB40 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Med27Q9DB40 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Med27Q9DB40 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Med27Q9DB40 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Med27Q9DB40 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Med27Q9DB40 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Med27Q9DB40 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Med27Q9DB40 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Med27Q9DB40 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Med27Q9DB40 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Med27Q9DB40 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Med27Q9DB40 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Med27Q9DB40 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Med27Q9DB40 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Med27Q9DB40 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Med27Q9DB40 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Med27Q9DB40 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Med27Q9DB40 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Med27Q9DB40 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Med27Q9DB40 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Med27Q9DB40 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Med27Q9DB40 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Med27Q9DB40 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Med27Q9DB40 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Med27Q9DB40 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Med27Q9DB40 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Med27Q9DB40 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Med27Q9DB40 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Med27Q9DB40 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Med27Q9DB40 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Med27Q9DB40 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Med27Q9DB40 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Med27Q9DB40 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Med27Q9DB40 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Med27Q9DB40 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Med27Q9DB40 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Med27Q9DB40 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Med27Q9DB40 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Med27Q9DB40 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Med27Q9DB40 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Med27Q9DB40 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Med27Q9DB40 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Med27Q9DB40 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms