Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snx5Q9D8U8 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snx5Q9D8U8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snx5Q9D8U8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snx5Q9D8U8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snx5Q9D8U8 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snx5Q9D8U8 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snx5Q9D8U8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snx5Q9D8U8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snx5Q9D8U8 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snx5Q9D8U8 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snx5Q9D8U8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snx5Q9D8U8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snx5Q9D8U8 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx5Q9D8U8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx5Q9D8U8 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx5Q9D8U8 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx5Q9D8U8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx5Q9D8U8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx5Q9D8U8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx5Q9D8U8 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx5Q9D8U8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx5Q9D8U8 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx5Q9D8U8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx5Q9D8U8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx5Q9D8U8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx5Q9D8U8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx5Q9D8U8 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx5Q9D8U8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx5Q9D8U8 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx5Q9D8U8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx5Q9D8U8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx5Q9D8U8 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx5Q9D8U8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx5Q9D8U8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx5Q9D8U8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx5Q9D8U8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx5Q9D8U8 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx5Q9D8U8 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx5Q9D8U8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx5Q9D8U8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx5Q9D8U8 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx5Q9D8U8 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx5Q9D8U8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx5Q9D8U8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx5Q9D8U8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx5Q9D8U8 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx5Q9D8U8 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx5Q9D8U8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx5Q9D8U8 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx5Q9D8U8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx5Q9D8U8 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx5Q9D8U8 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx5Q9D8U8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx5Q9D8U8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx5Q9D8U8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx5Q9D8U8 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx5Q9D8U8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx5Q9D8U8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx5Q9D8U8 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx5Q9D8U8 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx5Q9D8U8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx5Q9D8U8 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx5Q9D8U8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx5Q9D8U8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx5Q9D8U8 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx5Q9D8U8 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snx5Q9D8U8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snx5Q9D8U8 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snx5Q9D8U8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Snx5Q9D8U8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snx5Q9D8U8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snx5Q9D8U8 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snx5Q9D8U8 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snx5Q9D8U8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snx5Q9D8U8 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snx5Q9D8U8 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snx5Q9D8U8 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snx5Q9D8U8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snx5Q9D8U8 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snx5Q9D8U8 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snx5Q9D8U8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snx5Q9D8U8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snx5Q9D8U8 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snx5Q9D8U8 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snx5Q9D8U8 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snx5Q9D8U8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snx5Q9D8U8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snx5Q9D8U8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snx5Q9D8U8 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snx5Q9D8U8 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snx5Q9D8U8 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snx5Q9D8U8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snx5Q9D8U8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snx5Q9D8U8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snx5Q9D8U8 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snx5Q9D8U8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snx5Q9D8U8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snx5Q9D8U8 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snx5Q9D8U8 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms