Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Chmp4bQ9D8B3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Chmp4bQ9D8B3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Chmp4bQ9D8B3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Chmp4bQ9D8B3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Chmp4bQ9D8B3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Chmp4bQ9D8B3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Chmp4bQ9D8B3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Chmp4bQ9D8B3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Chmp4bQ9D8B3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Chmp4bQ9D8B3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Chmp4bQ9D8B3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Chmp4bQ9D8B3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Chmp4bQ9D8B3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chmp4bQ9D8B3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chmp4bQ9D8B3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chmp4bQ9D8B3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chmp4bQ9D8B3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Chmp4bQ9D8B3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chmp4bQ9D8B3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chmp4bQ9D8B3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Chmp4bQ9D8B3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chmp4bQ9D8B3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chmp4bQ9D8B3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chmp4bQ9D8B3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chmp4bQ9D8B3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chmp4bQ9D8B3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chmp4bQ9D8B3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chmp4bQ9D8B3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chmp4bQ9D8B3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Chmp4bQ9D8B3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chmp4bQ9D8B3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chmp4bQ9D8B3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chmp4bQ9D8B3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chmp4bQ9D8B3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chmp4bQ9D8B3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chmp4bQ9D8B3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chmp4bQ9D8B3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chmp4bQ9D8B3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chmp4bQ9D8B3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chmp4bQ9D8B3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Chmp4bQ9D8B3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chmp4bQ9D8B3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chmp4bQ9D8B3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Chmp4bQ9D8B3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chmp4bQ9D8B3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Chmp4bQ9D8B3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chmp4bQ9D8B3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chmp4bQ9D8B3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chmp4bQ9D8B3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chmp4bQ9D8B3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chmp4bQ9D8B3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chmp4bQ9D8B3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chmp4bQ9D8B3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chmp4bQ9D8B3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chmp4bQ9D8B3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Chmp4bQ9D8B3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chmp4bQ9D8B3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chmp4bQ9D8B3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chmp4bQ9D8B3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chmp4bQ9D8B3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chmp4bQ9D8B3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chmp4bQ9D8B3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chmp4bQ9D8B3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chmp4bQ9D8B3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chmp4bQ9D8B3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chmp4bQ9D8B3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chmp4bQ9D8B3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chmp4bQ9D8B3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chmp4bQ9D8B3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chmp4bQ9D8B3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chmp4bQ9D8B3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chmp4bQ9D8B3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chmp4bQ9D8B3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chmp4bQ9D8B3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chmp4bQ9D8B3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chmp4bQ9D8B3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chmp4bQ9D8B3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chmp4bQ9D8B3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chmp4bQ9D8B3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chmp4bQ9D8B3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chmp4bQ9D8B3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chmp4bQ9D8B3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Chmp4bQ9D8B3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chmp4bQ9D8B3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chmp4bQ9D8B3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chmp4bQ9D8B3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chmp4bQ9D8B3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chmp4bQ9D8B3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chmp4bQ9D8B3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chmp4bQ9D8B3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Chmp4bQ9D8B3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Chmp4bQ9D8B3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chmp4bQ9D8B3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chmp4bQ9D8B3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chmp4bQ9D8B3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chmp4bQ9D8B3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chmp4bQ9D8B3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chmp4bQ9D8B3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chmp4bQ9D8B3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms