Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chmp4cQ9D7F7 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chmp4cQ9D7F7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chmp4cQ9D7F7 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chmp4cQ9D7F7 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Chmp4cQ9D7F7 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chmp4cQ9D7F7 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chmp4cQ9D7F7 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chmp4cQ9D7F7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chmp4cQ9D7F7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chmp4cQ9D7F7 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chmp4cQ9D7F7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chmp4cQ9D7F7 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chmp4cQ9D7F7 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chmp4cQ9D7F7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Chmp4cQ9D7F7 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chmp4cQ9D7F7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chmp4cQ9D7F7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chmp4cQ9D7F7 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chmp4cQ9D7F7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chmp4cQ9D7F7 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chmp4cQ9D7F7 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chmp4cQ9D7F7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chmp4cQ9D7F7 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chmp4cQ9D7F7 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chmp4cQ9D7F7 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chmp4cQ9D7F7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chmp4cQ9D7F7 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Chmp4cQ9D7F7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chmp4cQ9D7F7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chmp4cQ9D7F7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Chmp4cQ9D7F7 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Chmp4cQ9D7F7 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chmp4cQ9D7F7 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chmp4cQ9D7F7 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chmp4cQ9D7F7 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chmp4cQ9D7F7 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chmp4cQ9D7F7 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chmp4cQ9D7F7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chmp4cQ9D7F7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chmp4cQ9D7F7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chmp4cQ9D7F7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chmp4cQ9D7F7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chmp4cQ9D7F7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chmp4cQ9D7F7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chmp4cQ9D7F7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chmp4cQ9D7F7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chmp4cQ9D7F7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chmp4cQ9D7F7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chmp4cQ9D7F7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chmp4cQ9D7F7 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chmp4cQ9D7F7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chmp4cQ9D7F7 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chmp4cQ9D7F7 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chmp4cQ9D7F7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chmp4cQ9D7F7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chmp4cQ9D7F7 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chmp4cQ9D7F7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chmp4cQ9D7F7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chmp4cQ9D7F7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chmp4cQ9D7F7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chmp4cQ9D7F7 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chmp4cQ9D7F7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chmp4cQ9D7F7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chmp4cQ9D7F7 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chmp4cQ9D7F7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chmp4cQ9D7F7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chmp4cQ9D7F7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chmp4cQ9D7F7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chmp4cQ9D7F7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chmp4cQ9D7F7 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chmp4cQ9D7F7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chmp4cQ9D7F7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chmp4cQ9D7F7 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chmp4cQ9D7F7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chmp4cQ9D7F7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chmp4cQ9D7F7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chmp4cQ9D7F7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chmp4cQ9D7F7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chmp4cQ9D7F7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chmp4cQ9D7F7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chmp4cQ9D7F7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chmp4cQ9D7F7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chmp4cQ9D7F7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chmp4cQ9D7F7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chmp4cQ9D7F7 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chmp4cQ9D7F7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Chmp4cQ9D7F7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chmp4cQ9D7F7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chmp4cQ9D7F7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chmp4cQ9D7F7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chmp4cQ9D7F7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chmp4cQ9D7F7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chmp4cQ9D7F7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Chmp4cQ9D7F7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chmp4cQ9D7F7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chmp4cQ9D7F7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chmp4cQ9D7F7 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chmp4cQ9D7F7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chmp4cQ9D7F7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms