Protein–RNA interactions for Protein: Q9D742

Ap5s1, AP-5 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap5s1Q9D742 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ap5s1Q9D742 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ap5s1Q9D742 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ap5s1Q9D742 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ap5s1Q9D742 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ap5s1Q9D742 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ap5s1Q9D742 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ap5s1Q9D742 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ap5s1Q9D742 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ap5s1Q9D742 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ap5s1Q9D742 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ap5s1Q9D742 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ap5s1Q9D742 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ap5s1Q9D742 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ap5s1Q9D742 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ap5s1Q9D742 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ap5s1Q9D742 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ap5s1Q9D742 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ap5s1Q9D742 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ap5s1Q9D742 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ap5s1Q9D742 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ap5s1Q9D742 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ap5s1Q9D742 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ap5s1Q9D742 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ap5s1Q9D742 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ap5s1Q9D742 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ap5s1Q9D742 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ap5s1Q9D742 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ap5s1Q9D742 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ap5s1Q9D742 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ap5s1Q9D742 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ap5s1Q9D742 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ap5s1Q9D742 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ap5s1Q9D742 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ap5s1Q9D742 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ap5s1Q9D742 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ap5s1Q9D742 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ap5s1Q9D742 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ap5s1Q9D742 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ap5s1Q9D742 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ap5s1Q9D742 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ap5s1Q9D742 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ap5s1Q9D742 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ap5s1Q9D742 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ap5s1Q9D742 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ap5s1Q9D742 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ap5s1Q9D742 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ap5s1Q9D742 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ap5s1Q9D742 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ap5s1Q9D742 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ap5s1Q9D742 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ap5s1Q9D742 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ap5s1Q9D742 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap5s1Q9D742 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap5s1Q9D742 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap5s1Q9D742 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap5s1Q9D742 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap5s1Q9D742 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap5s1Q9D742 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap5s1Q9D742 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap5s1Q9D742 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap5s1Q9D742 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap5s1Q9D742 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap5s1Q9D742 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap5s1Q9D742 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap5s1Q9D742 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap5s1Q9D742 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap5s1Q9D742 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap5s1Q9D742 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap5s1Q9D742 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap5s1Q9D742 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap5s1Q9D742 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap5s1Q9D742 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap5s1Q9D742 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap5s1Q9D742 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap5s1Q9D742 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap5s1Q9D742 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap5s1Q9D742 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap5s1Q9D742 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap5s1Q9D742 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap5s1Q9D742 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap5s1Q9D742 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap5s1Q9D742 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap5s1Q9D742 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap5s1Q9D742 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap5s1Q9D742 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap5s1Q9D742 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap5s1Q9D742 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap5s1Q9D742 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap5s1Q9D742 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap5s1Q9D742 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap5s1Q9D742 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap5s1Q9D742 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap5s1Q9D742 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap5s1Q9D742 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap5s1Q9D742 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap5s1Q9D742 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap5s1Q9D742 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap5s1Q9D742 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap5s1Q9D742 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms