Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y9

Gbe1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbe1Q9D6Y9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbe1Q9D6Y9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbe1Q9D6Y9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gbe1Q9D6Y9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gbe1Q9D6Y9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gbe1Q9D6Y9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gbe1Q9D6Y9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gbe1Q9D6Y9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gbe1Q9D6Y9 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gbe1Q9D6Y9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gbe1Q9D6Y9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gbe1Q9D6Y9 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gbe1Q9D6Y9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gbe1Q9D6Y9 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gbe1Q9D6Y9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gbe1Q9D6Y9 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbe1Q9D6Y9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbe1Q9D6Y9 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbe1Q9D6Y9 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbe1Q9D6Y9 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbe1Q9D6Y9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbe1Q9D6Y9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbe1Q9D6Y9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbe1Q9D6Y9 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbe1Q9D6Y9 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbe1Q9D6Y9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbe1Q9D6Y9 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbe1Q9D6Y9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbe1Q9D6Y9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbe1Q9D6Y9 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbe1Q9D6Y9 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbe1Q9D6Y9 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbe1Q9D6Y9 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbe1Q9D6Y9 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbe1Q9D6Y9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbe1Q9D6Y9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbe1Q9D6Y9 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbe1Q9D6Y9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbe1Q9D6Y9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbe1Q9D6Y9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbe1Q9D6Y9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbe1Q9D6Y9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbe1Q9D6Y9 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbe1Q9D6Y9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbe1Q9D6Y9 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbe1Q9D6Y9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbe1Q9D6Y9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbe1Q9D6Y9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbe1Q9D6Y9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbe1Q9D6Y9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbe1Q9D6Y9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbe1Q9D6Y9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbe1Q9D6Y9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbe1Q9D6Y9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbe1Q9D6Y9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbe1Q9D6Y9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbe1Q9D6Y9 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbe1Q9D6Y9 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbe1Q9D6Y9 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbe1Q9D6Y9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbe1Q9D6Y9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbe1Q9D6Y9 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbe1Q9D6Y9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbe1Q9D6Y9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbe1Q9D6Y9 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbe1Q9D6Y9 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbe1Q9D6Y9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbe1Q9D6Y9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbe1Q9D6Y9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbe1Q9D6Y9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbe1Q9D6Y9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbe1Q9D6Y9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbe1Q9D6Y9 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbe1Q9D6Y9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbe1Q9D6Y9 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbe1Q9D6Y9 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbe1Q9D6Y9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbe1Q9D6Y9 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbe1Q9D6Y9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbe1Q9D6Y9 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbe1Q9D6Y9 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbe1Q9D6Y9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbe1Q9D6Y9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbe1Q9D6Y9 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbe1Q9D6Y9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbe1Q9D6Y9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbe1Q9D6Y9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbe1Q9D6Y9 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbe1Q9D6Y9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbe1Q9D6Y9 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbe1Q9D6Y9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbe1Q9D6Y9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbe1Q9D6Y9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbe1Q9D6Y9 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbe1Q9D6Y9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbe1Q9D6Y9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbe1Q9D6Y9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbe1Q9D6Y9 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbe1Q9D6Y9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbe1Q9D6Y9 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms