Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc94Q9D6J3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc94Q9D6J3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc94Q9D6J3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc94Q9D6J3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc94Q9D6J3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc94Q9D6J3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc94Q9D6J3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc94Q9D6J3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc94Q9D6J3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc94Q9D6J3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc94Q9D6J3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc94Q9D6J3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc94Q9D6J3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc94Q9D6J3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc94Q9D6J3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc94Q9D6J3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc94Q9D6J3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc94Q9D6J3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc94Q9D6J3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc94Q9D6J3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc94Q9D6J3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc94Q9D6J3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc94Q9D6J3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc94Q9D6J3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc94Q9D6J3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc94Q9D6J3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc94Q9D6J3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc94Q9D6J3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc94Q9D6J3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc94Q9D6J3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc94Q9D6J3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc94Q9D6J3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc94Q9D6J3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc94Q9D6J3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc94Q9D6J3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc94Q9D6J3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc94Q9D6J3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc94Q9D6J3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc94Q9D6J3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc94Q9D6J3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc94Q9D6J3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc94Q9D6J3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc94Q9D6J3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc94Q9D6J3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc94Q9D6J3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc94Q9D6J3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc94Q9D6J3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc94Q9D6J3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc94Q9D6J3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc94Q9D6J3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc94Q9D6J3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc94Q9D6J3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc94Q9D6J3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc94Q9D6J3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc94Q9D6J3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc94Q9D6J3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc94Q9D6J3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc94Q9D6J3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc94Q9D6J3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccdc94Q9D6J3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccdc94Q9D6J3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccdc94Q9D6J3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc94Q9D6J3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc94Q9D6J3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc94Q9D6J3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc94Q9D6J3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc94Q9D6J3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc94Q9D6J3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc94Q9D6J3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc94Q9D6J3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc94Q9D6J3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc94Q9D6J3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc94Q9D6J3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc94Q9D6J3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc94Q9D6J3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc94Q9D6J3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc94Q9D6J3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc94Q9D6J3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc94Q9D6J3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc94Q9D6J3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc94Q9D6J3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc94Q9D6J3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc94Q9D6J3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc94Q9D6J3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc94Q9D6J3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc94Q9D6J3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc94Q9D6J3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc94Q9D6J3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc94Q9D6J3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc94Q9D6J3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc94Q9D6J3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc94Q9D6J3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc94Q9D6J3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc94Q9D6J3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc94Q9D6J3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc94Q9D6J3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc94Q9D6J3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc94Q9D6J3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc94Q9D6J3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms