Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F9

Tubb4a, Tubulin beta-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4aQ9D6F9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tubb4aQ9D6F9 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tubb4aQ9D6F9 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tubb4aQ9D6F9 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tubb4aQ9D6F9 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tubb4aQ9D6F9 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tubb4aQ9D6F9 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tubb4aQ9D6F9 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tubb4aQ9D6F9 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tubb4aQ9D6F9 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tubb4aQ9D6F9 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tubb4aQ9D6F9 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tubb4aQ9D6F9 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tubb4aQ9D6F9 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tubb4aQ9D6F9 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tubb4aQ9D6F9 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Tubb4aQ9D6F9 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tubb4aQ9D6F9 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tubb4aQ9D6F9 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tubb4aQ9D6F9 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tubb4aQ9D6F9 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tubb4aQ9D6F9 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Tubb4aQ9D6F9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tubb4aQ9D6F9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tubb4aQ9D6F9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tubb4aQ9D6F9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tubb4aQ9D6F9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tubb4aQ9D6F9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tubb4aQ9D6F9 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tubb4aQ9D6F9 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Tubb4aQ9D6F9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tubb4aQ9D6F9 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tubb4aQ9D6F9 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tubb4aQ9D6F9 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tubb4aQ9D6F9 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tubb4aQ9D6F9 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tubb4aQ9D6F9 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tubb4aQ9D6F9 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tubb4aQ9D6F9 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tubb4aQ9D6F9 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tubb4aQ9D6F9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tubb4aQ9D6F9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tubb4aQ9D6F9 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Tubb4aQ9D6F9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Tubb4aQ9D6F9 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tubb4aQ9D6F9 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tubb4aQ9D6F9 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tubb4aQ9D6F9 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tubb4aQ9D6F9 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tubb4aQ9D6F9 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tubb4aQ9D6F9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tubb4aQ9D6F9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tubb4aQ9D6F9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tubb4aQ9D6F9 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tubb4aQ9D6F9 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tubb4aQ9D6F9 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tubb4aQ9D6F9 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tubb4aQ9D6F9 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tubb4aQ9D6F9 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tubb4aQ9D6F9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tubb4aQ9D6F9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tubb4aQ9D6F9 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tubb4aQ9D6F9 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tubb4aQ9D6F9 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tubb4aQ9D6F9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tubb4aQ9D6F9 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tubb4aQ9D6F9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tubb4aQ9D6F9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tubb4aQ9D6F9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Tubb4aQ9D6F9 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tubb4aQ9D6F9 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tubb4aQ9D6F9 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tubb4aQ9D6F9 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tubb4aQ9D6F9 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Tubb4aQ9D6F9 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tubb4aQ9D6F9 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tubb4aQ9D6F9 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tubb4aQ9D6F9 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tubb4aQ9D6F9 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tubb4aQ9D6F9 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tubb4aQ9D6F9 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tubb4aQ9D6F9 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tubb4aQ9D6F9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tubb4aQ9D6F9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tubb4aQ9D6F9 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tubb4aQ9D6F9 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tubb4aQ9D6F9 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tubb4aQ9D6F9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tubb4aQ9D6F9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tubb4aQ9D6F9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tubb4aQ9D6F9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tubb4aQ9D6F9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tubb4aQ9D6F9 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tubb4aQ9D6F9 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tubb4aQ9D6F9 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tubb4aQ9D6F9 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tubb4aQ9D6F9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tubb4aQ9D6F9 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tubb4aQ9D6F9 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tubb4aQ9D6F9 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms