Protein–RNA interactions for Protein: Q9D413

Sh2d6, SH2 domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d6Q9D413 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh2d6Q9D413 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh2d6Q9D413 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh2d6Q9D413 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh2d6Q9D413 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh2d6Q9D413 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh2d6Q9D413 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh2d6Q9D413 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh2d6Q9D413 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh2d6Q9D413 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh2d6Q9D413 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh2d6Q9D413 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh2d6Q9D413 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh2d6Q9D413 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh2d6Q9D413 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh2d6Q9D413 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh2d6Q9D413 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh2d6Q9D413 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh2d6Q9D413 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh2d6Q9D413 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh2d6Q9D413 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh2d6Q9D413 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh2d6Q9D413 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh2d6Q9D413 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh2d6Q9D413 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh2d6Q9D413 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh2d6Q9D413 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh2d6Q9D413 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d6Q9D413 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d6Q9D413 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d6Q9D413 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d6Q9D413 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d6Q9D413 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d6Q9D413 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d6Q9D413 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d6Q9D413 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d6Q9D413 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh2d6Q9D413 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh2d6Q9D413 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh2d6Q9D413 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh2d6Q9D413 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh2d6Q9D413 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh2d6Q9D413 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh2d6Q9D413 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh2d6Q9D413 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh2d6Q9D413 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh2d6Q9D413 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh2d6Q9D413 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh2d6Q9D413 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sh2d6Q9D413 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sh2d6Q9D413 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sh2d6Q9D413 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sh2d6Q9D413 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d6Q9D413 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d6Q9D413 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d6Q9D413 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d6Q9D413 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d6Q9D413 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d6Q9D413 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d6Q9D413 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d6Q9D413 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d6Q9D413 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d6Q9D413 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d6Q9D413 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d6Q9D413 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d6Q9D413 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d6Q9D413 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d6Q9D413 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh2d6Q9D413 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh2d6Q9D413 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh2d6Q9D413 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh2d6Q9D413 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh2d6Q9D413 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh2d6Q9D413 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh2d6Q9D413 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh2d6Q9D413 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh2d6Q9D413 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh2d6Q9D413 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh2d6Q9D413 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh2d6Q9D413 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh2d6Q9D413 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh2d6Q9D413 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh2d6Q9D413 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d6Q9D413 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d6Q9D413 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d6Q9D413 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d6Q9D413 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d6Q9D413 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d6Q9D413 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d6Q9D413 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d6Q9D413 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d6Q9D413 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d6Q9D413 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d6Q9D413 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d6Q9D413 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d6Q9D413 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d6Q9D413 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d6Q9D413 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d6Q9D413 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d6Q9D413 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms