Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1G1

Rab1b, Ras-related protein Rab-1B, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab1bQ9D1G1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab1bQ9D1G1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab1bQ9D1G1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab1bQ9D1G1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab1bQ9D1G1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab1bQ9D1G1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab1bQ9D1G1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab1bQ9D1G1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab1bQ9D1G1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab1bQ9D1G1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab1bQ9D1G1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab1bQ9D1G1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab1bQ9D1G1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab1bQ9D1G1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab1bQ9D1G1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab1bQ9D1G1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab1bQ9D1G1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab1bQ9D1G1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab1bQ9D1G1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab1bQ9D1G1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab1bQ9D1G1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab1bQ9D1G1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab1bQ9D1G1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab1bQ9D1G1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab1bQ9D1G1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab1bQ9D1G1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab1bQ9D1G1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab1bQ9D1G1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab1bQ9D1G1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab1bQ9D1G1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab1bQ9D1G1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab1bQ9D1G1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab1bQ9D1G1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab1bQ9D1G1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab1bQ9D1G1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab1bQ9D1G1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab1bQ9D1G1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab1bQ9D1G1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab1bQ9D1G1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab1bQ9D1G1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab1bQ9D1G1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab1bQ9D1G1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab1bQ9D1G1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab1bQ9D1G1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab1bQ9D1G1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab1bQ9D1G1 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab1bQ9D1G1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab1bQ9D1G1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab1bQ9D1G1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab1bQ9D1G1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab1bQ9D1G1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab1bQ9D1G1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab1bQ9D1G1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab1bQ9D1G1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab1bQ9D1G1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab1bQ9D1G1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab1bQ9D1G1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab1bQ9D1G1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab1bQ9D1G1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab1bQ9D1G1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab1bQ9D1G1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab1bQ9D1G1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab1bQ9D1G1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab1bQ9D1G1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab1bQ9D1G1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab1bQ9D1G1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab1bQ9D1G1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab1bQ9D1G1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab1bQ9D1G1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab1bQ9D1G1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab1bQ9D1G1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab1bQ9D1G1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab1bQ9D1G1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab1bQ9D1G1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab1bQ9D1G1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab1bQ9D1G1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab1bQ9D1G1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab1bQ9D1G1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab1bQ9D1G1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab1bQ9D1G1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab1bQ9D1G1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab1bQ9D1G1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab1bQ9D1G1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab1bQ9D1G1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab1bQ9D1G1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab1bQ9D1G1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab1bQ9D1G1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab1bQ9D1G1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab1bQ9D1G1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab1bQ9D1G1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab1bQ9D1G1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab1bQ9D1G1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab1bQ9D1G1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab1bQ9D1G1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab1bQ9D1G1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab1bQ9D1G1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab1bQ9D1G1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab1bQ9D1G1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab1bQ9D1G1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab1bQ9D1G1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms