Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gtf2e1Q9D0D5 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gtf2e1Q9D0D5 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gtf2e1Q9D0D5 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gtf2e1Q9D0D5 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Gtf2e1Q9D0D5 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gtf2e1Q9D0D5 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gtf2e1Q9D0D5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gtf2e1Q9D0D5 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gtf2e1Q9D0D5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gtf2e1Q9D0D5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gtf2e1Q9D0D5 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gtf2e1Q9D0D5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gtf2e1Q9D0D5 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gtf2e1Q9D0D5 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Gtf2e1Q9D0D5 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Gtf2e1Q9D0D5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gtf2e1Q9D0D5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gtf2e1Q9D0D5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gtf2e1Q9D0D5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gtf2e1Q9D0D5 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gtf2e1Q9D0D5 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Gtf2e1Q9D0D5 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Gtf2e1Q9D0D5 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gtf2e1Q9D0D5 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gtf2e1Q9D0D5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gtf2e1Q9D0D5 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gtf2e1Q9D0D5 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gtf2e1Q9D0D5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gtf2e1Q9D0D5 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gtf2e1Q9D0D5 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gtf2e1Q9D0D5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gtf2e1Q9D0D5 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gtf2e1Q9D0D5 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gtf2e1Q9D0D5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gtf2e1Q9D0D5 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gtf2e1Q9D0D5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gtf2e1Q9D0D5 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gtf2e1Q9D0D5 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gtf2e1Q9D0D5 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gtf2e1Q9D0D5 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gtf2e1Q9D0D5 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Gtf2e1Q9D0D5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Gtf2e1Q9D0D5 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gtf2e1Q9D0D5 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gtf2e1Q9D0D5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gtf2e1Q9D0D5 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gtf2e1Q9D0D5 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gtf2e1Q9D0D5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gtf2e1Q9D0D5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gtf2e1Q9D0D5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gtf2e1Q9D0D5 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gtf2e1Q9D0D5 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gtf2e1Q9D0D5 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gtf2e1Q9D0D5 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gtf2e1Q9D0D5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Gtf2e1Q9D0D5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gtf2e1Q9D0D5 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gtf2e1Q9D0D5 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gtf2e1Q9D0D5 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gtf2e1Q9D0D5 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gtf2e1Q9D0D5 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gtf2e1Q9D0D5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gtf2e1Q9D0D5 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gtf2e1Q9D0D5 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gtf2e1Q9D0D5 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gtf2e1Q9D0D5 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gtf2e1Q9D0D5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gtf2e1Q9D0D5 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gtf2e1Q9D0D5 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gtf2e1Q9D0D5 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gtf2e1Q9D0D5 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gtf2e1Q9D0D5 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gtf2e1Q9D0D5 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gtf2e1Q9D0D5 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gtf2e1Q9D0D5 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gtf2e1Q9D0D5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gtf2e1Q9D0D5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gtf2e1Q9D0D5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gtf2e1Q9D0D5 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gtf2e1Q9D0D5 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gtf2e1Q9D0D5 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gtf2e1Q9D0D5 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gtf2e1Q9D0D5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gtf2e1Q9D0D5 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gtf2e1Q9D0D5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gtf2e1Q9D0D5 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gtf2e1Q9D0D5 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gtf2e1Q9D0D5 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gtf2e1Q9D0D5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gtf2e1Q9D0D5 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms