Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT8

Rab3b, Ras-related protein Rab-3B, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3bQ9CZT8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab3bQ9CZT8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab3bQ9CZT8 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab3bQ9CZT8 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab3bQ9CZT8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab3bQ9CZT8 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab3bQ9CZT8 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab3bQ9CZT8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab3bQ9CZT8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab3bQ9CZT8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab3bQ9CZT8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab3bQ9CZT8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab3bQ9CZT8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab3bQ9CZT8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab3bQ9CZT8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab3bQ9CZT8 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab3bQ9CZT8 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab3bQ9CZT8 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab3bQ9CZT8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab3bQ9CZT8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab3bQ9CZT8 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab3bQ9CZT8 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab3bQ9CZT8 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab3bQ9CZT8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab3bQ9CZT8 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab3bQ9CZT8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab3bQ9CZT8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab3bQ9CZT8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab3bQ9CZT8 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab3bQ9CZT8 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab3bQ9CZT8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab3bQ9CZT8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab3bQ9CZT8 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab3bQ9CZT8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab3bQ9CZT8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab3bQ9CZT8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab3bQ9CZT8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab3bQ9CZT8 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab3bQ9CZT8 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab3bQ9CZT8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rab3bQ9CZT8 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rab3bQ9CZT8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab3bQ9CZT8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab3bQ9CZT8 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab3bQ9CZT8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab3bQ9CZT8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab3bQ9CZT8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab3bQ9CZT8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab3bQ9CZT8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab3bQ9CZT8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab3bQ9CZT8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab3bQ9CZT8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab3bQ9CZT8 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab3bQ9CZT8 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab3bQ9CZT8 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab3bQ9CZT8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab3bQ9CZT8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab3bQ9CZT8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab3bQ9CZT8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab3bQ9CZT8 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab3bQ9CZT8 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab3bQ9CZT8 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab3bQ9CZT8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab3bQ9CZT8 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab3bQ9CZT8 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab3bQ9CZT8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab3bQ9CZT8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab3bQ9CZT8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab3bQ9CZT8 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab3bQ9CZT8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab3bQ9CZT8 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab3bQ9CZT8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab3bQ9CZT8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab3bQ9CZT8 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab3bQ9CZT8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab3bQ9CZT8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab3bQ9CZT8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab3bQ9CZT8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab3bQ9CZT8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab3bQ9CZT8 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab3bQ9CZT8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab3bQ9CZT8 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab3bQ9CZT8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab3bQ9CZT8 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab3bQ9CZT8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab3bQ9CZT8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab3bQ9CZT8 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab3bQ9CZT8 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab3bQ9CZT8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab3bQ9CZT8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab3bQ9CZT8 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab3bQ9CZT8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab3bQ9CZT8 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab3bQ9CZT8 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab3bQ9CZT8 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab3bQ9CZT8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab3bQ9CZT8 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab3bQ9CZT8 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab3bQ9CZT8 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab3bQ9CZT8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms