Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYY7

Prelid3b, PRELI domain containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prelid3bQ9CYY7 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prelid3bQ9CYY7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prelid3bQ9CYY7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prelid3bQ9CYY7 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prelid3bQ9CYY7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prelid3bQ9CYY7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prelid3bQ9CYY7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prelid3bQ9CYY7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prelid3bQ9CYY7 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prelid3bQ9CYY7 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prelid3bQ9CYY7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prelid3bQ9CYY7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prelid3bQ9CYY7 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prelid3bQ9CYY7 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prelid3bQ9CYY7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prelid3bQ9CYY7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prelid3bQ9CYY7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prelid3bQ9CYY7 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prelid3bQ9CYY7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prelid3bQ9CYY7 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prelid3bQ9CYY7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prelid3bQ9CYY7 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prelid3bQ9CYY7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prelid3bQ9CYY7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prelid3bQ9CYY7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prelid3bQ9CYY7 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prelid3bQ9CYY7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prelid3bQ9CYY7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prelid3bQ9CYY7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prelid3bQ9CYY7 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prelid3bQ9CYY7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prelid3bQ9CYY7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prelid3bQ9CYY7 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prelid3bQ9CYY7 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Prelid3bQ9CYY7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prelid3bQ9CYY7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Prelid3bQ9CYY7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prelid3bQ9CYY7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prelid3bQ9CYY7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prelid3bQ9CYY7 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prelid3bQ9CYY7 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prelid3bQ9CYY7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prelid3bQ9CYY7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prelid3bQ9CYY7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prelid3bQ9CYY7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prelid3bQ9CYY7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prelid3bQ9CYY7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prelid3bQ9CYY7 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prelid3bQ9CYY7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prelid3bQ9CYY7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Prelid3bQ9CYY7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prelid3bQ9CYY7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prelid3bQ9CYY7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prelid3bQ9CYY7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Prelid3bQ9CYY7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prelid3bQ9CYY7 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prelid3bQ9CYY7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prelid3bQ9CYY7 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prelid3bQ9CYY7 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prelid3bQ9CYY7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prelid3bQ9CYY7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prelid3bQ9CYY7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prelid3bQ9CYY7 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prelid3bQ9CYY7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prelid3bQ9CYY7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prelid3bQ9CYY7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prelid3bQ9CYY7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prelid3bQ9CYY7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prelid3bQ9CYY7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prelid3bQ9CYY7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prelid3bQ9CYY7 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prelid3bQ9CYY7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prelid3bQ9CYY7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prelid3bQ9CYY7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prelid3bQ9CYY7 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prelid3bQ9CYY7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Prelid3bQ9CYY7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prelid3bQ9CYY7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prelid3bQ9CYY7 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prelid3bQ9CYY7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prelid3bQ9CYY7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prelid3bQ9CYY7 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prelid3bQ9CYY7 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prelid3bQ9CYY7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prelid3bQ9CYY7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prelid3bQ9CYY7 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prelid3bQ9CYY7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prelid3bQ9CYY7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prelid3bQ9CYY7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prelid3bQ9CYY7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prelid3bQ9CYY7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prelid3bQ9CYY7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prelid3bQ9CYY7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prelid3bQ9CYY7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prelid3bQ9CYY7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prelid3bQ9CYY7 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prelid3bQ9CYY7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prelid3bQ9CYY7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prelid3bQ9CYY7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prelid3bQ9CYY7 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms