Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cxxc1Q9CWW7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cxxc1Q9CWW7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cxxc1Q9CWW7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cxxc1Q9CWW7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cxxc1Q9CWW7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cxxc1Q9CWW7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cxxc1Q9CWW7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cxxc1Q9CWW7 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cxxc1Q9CWW7 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Cxxc1Q9CWW7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cxxc1Q9CWW7 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cxxc1Q9CWW7 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cxxc1Q9CWW7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cxxc1Q9CWW7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cxxc1Q9CWW7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cxxc1Q9CWW7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cxxc1Q9CWW7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cxxc1Q9CWW7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cxxc1Q9CWW7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cxxc1Q9CWW7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cxxc1Q9CWW7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cxxc1Q9CWW7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cxxc1Q9CWW7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cxxc1Q9CWW7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Cxxc1Q9CWW7 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cxxc1Q9CWW7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cxxc1Q9CWW7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cxxc1Q9CWW7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cxxc1Q9CWW7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Cxxc1Q9CWW7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cxxc1Q9CWW7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cxxc1Q9CWW7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cxxc1Q9CWW7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cxxc1Q9CWW7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cxxc1Q9CWW7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cxxc1Q9CWW7 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cxxc1Q9CWW7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cxxc1Q9CWW7 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cxxc1Q9CWW7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Cxxc1Q9CWW7 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cxxc1Q9CWW7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cxxc1Q9CWW7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cxxc1Q9CWW7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cxxc1Q9CWW7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cxxc1Q9CWW7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cxxc1Q9CWW7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cxxc1Q9CWW7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cxxc1Q9CWW7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cxxc1Q9CWW7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cxxc1Q9CWW7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cxxc1Q9CWW7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cxxc1Q9CWW7 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cxxc1Q9CWW7 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Cxxc1Q9CWW7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Cxxc1Q9CWW7 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Cxxc1Q9CWW7 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cxxc1Q9CWW7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cxxc1Q9CWW7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cxxc1Q9CWW7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cxxc1Q9CWW7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cxxc1Q9CWW7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cxxc1Q9CWW7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cxxc1Q9CWW7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cxxc1Q9CWW7 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cxxc1Q9CWW7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cxxc1Q9CWW7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cxxc1Q9CWW7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cxxc1Q9CWW7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cxxc1Q9CWW7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cxxc1Q9CWW7 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cxxc1Q9CWW7 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cxxc1Q9CWW7 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Cxxc1Q9CWW7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cxxc1Q9CWW7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cxxc1Q9CWW7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cxxc1Q9CWW7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cxxc1Q9CWW7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cxxc1Q9CWW7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cxxc1Q9CWW7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Cxxc1Q9CWW7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Cxxc1Q9CWW7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cxxc1Q9CWW7 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cxxc1Q9CWW7 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cxxc1Q9CWW7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cxxc1Q9CWW7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cxxc1Q9CWW7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cxxc1Q9CWW7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cxxc1Q9CWW7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cxxc1Q9CWW7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cxxc1Q9CWW7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Cxxc1Q9CWW7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cxxc1Q9CWW7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cxxc1Q9CWW7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cxxc1Q9CWW7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
Cxxc1Q9CWW7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cxxc1Q9CWW7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cxxc1Q9CWW7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cxxc1Q9CWW7 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cxxc1Q9CWW7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms