Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atxn3Q9CVD2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Atxn3Q9CVD2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atxn3Q9CVD2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atxn3Q9CVD2 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atxn3Q9CVD2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atxn3Q9CVD2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atxn3Q9CVD2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atxn3Q9CVD2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atxn3Q9CVD2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atxn3Q9CVD2 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atxn3Q9CVD2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atxn3Q9CVD2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atxn3Q9CVD2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atxn3Q9CVD2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atxn3Q9CVD2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Atxn3Q9CVD2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atxn3Q9CVD2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atxn3Q9CVD2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atxn3Q9CVD2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atxn3Q9CVD2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atxn3Q9CVD2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atxn3Q9CVD2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atxn3Q9CVD2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atxn3Q9CVD2 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atxn3Q9CVD2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atxn3Q9CVD2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atxn3Q9CVD2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atxn3Q9CVD2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atxn3Q9CVD2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atxn3Q9CVD2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atxn3Q9CVD2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atxn3Q9CVD2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atxn3Q9CVD2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atxn3Q9CVD2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atxn3Q9CVD2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Atxn3Q9CVD2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Atxn3Q9CVD2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Atxn3Q9CVD2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Atxn3Q9CVD2 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Atxn3Q9CVD2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atxn3Q9CVD2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atxn3Q9CVD2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atxn3Q9CVD2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atxn3Q9CVD2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atxn3Q9CVD2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atxn3Q9CVD2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atxn3Q9CVD2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atxn3Q9CVD2 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Atxn3Q9CVD2 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atxn3Q9CVD2 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atxn3Q9CVD2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atxn3Q9CVD2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atxn3Q9CVD2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atxn3Q9CVD2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atxn3Q9CVD2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atxn3Q9CVD2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atxn3Q9CVD2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atxn3Q9CVD2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atxn3Q9CVD2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atxn3Q9CVD2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atxn3Q9CVD2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atxn3Q9CVD2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atxn3Q9CVD2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atxn3Q9CVD2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atxn3Q9CVD2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atxn3Q9CVD2 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atxn3Q9CVD2 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atxn3Q9CVD2 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atxn3Q9CVD2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atxn3Q9CVD2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atxn3Q9CVD2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atxn3Q9CVD2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atxn3Q9CVD2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atxn3Q9CVD2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atxn3Q9CVD2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atxn3Q9CVD2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atxn3Q9CVD2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atxn3Q9CVD2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atxn3Q9CVD2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Atxn3Q9CVD2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atxn3Q9CVD2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atxn3Q9CVD2 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atxn3Q9CVD2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atxn3Q9CVD2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atxn3Q9CVD2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atxn3Q9CVD2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atxn3Q9CVD2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atxn3Q9CVD2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atxn3Q9CVD2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atxn3Q9CVD2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atxn3Q9CVD2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atxn3Q9CVD2 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atxn3Q9CVD2 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atxn3Q9CVD2 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atxn3Q9CVD2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atxn3Q9CVD2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atxn3Q9CVD2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atxn3Q9CVD2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atxn3Q9CVD2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms