Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rprd1bQ9CSU0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rprd1bQ9CSU0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rprd1bQ9CSU0 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rprd1bQ9CSU0 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rprd1bQ9CSU0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rprd1bQ9CSU0 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rprd1bQ9CSU0 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rprd1bQ9CSU0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rprd1bQ9CSU0 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rprd1bQ9CSU0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rprd1bQ9CSU0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rprd1bQ9CSU0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rprd1bQ9CSU0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rprd1bQ9CSU0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rprd1bQ9CSU0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rprd1bQ9CSU0 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rprd1bQ9CSU0 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rprd1bQ9CSU0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rprd1bQ9CSU0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rprd1bQ9CSU0 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rprd1bQ9CSU0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rprd1bQ9CSU0 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rprd1bQ9CSU0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rprd1bQ9CSU0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rprd1bQ9CSU0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rprd1bQ9CSU0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rprd1bQ9CSU0 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rprd1bQ9CSU0 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rprd1bQ9CSU0 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rprd1bQ9CSU0 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rprd1bQ9CSU0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rprd1bQ9CSU0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rprd1bQ9CSU0 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rprd1bQ9CSU0 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rprd1bQ9CSU0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rprd1bQ9CSU0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rprd1bQ9CSU0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rprd1bQ9CSU0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rprd1bQ9CSU0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Rprd1bQ9CSU0 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rprd1bQ9CSU0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Rprd1bQ9CSU0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rprd1bQ9CSU0 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rprd1bQ9CSU0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rprd1bQ9CSU0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rprd1bQ9CSU0 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rprd1bQ9CSU0 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rprd1bQ9CSU0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rprd1bQ9CSU0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rprd1bQ9CSU0 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rprd1bQ9CSU0 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rprd1bQ9CSU0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rprd1bQ9CSU0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rprd1bQ9CSU0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rprd1bQ9CSU0 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rprd1bQ9CSU0 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rprd1bQ9CSU0 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rprd1bQ9CSU0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rprd1bQ9CSU0 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rprd1bQ9CSU0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rprd1bQ9CSU0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rprd1bQ9CSU0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rprd1bQ9CSU0 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rprd1bQ9CSU0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rprd1bQ9CSU0 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rprd1bQ9CSU0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rprd1bQ9CSU0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rprd1bQ9CSU0 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rprd1bQ9CSU0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rprd1bQ9CSU0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rprd1bQ9CSU0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rprd1bQ9CSU0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rprd1bQ9CSU0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rprd1bQ9CSU0 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rprd1bQ9CSU0 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rprd1bQ9CSU0 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rprd1bQ9CSU0 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rprd1bQ9CSU0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rprd1bQ9CSU0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rprd1bQ9CSU0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rprd1bQ9CSU0 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rprd1bQ9CSU0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rprd1bQ9CSU0 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rprd1bQ9CSU0 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rprd1bQ9CSU0 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rprd1bQ9CSU0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rprd1bQ9CSU0 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rprd1bQ9CSU0 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rprd1bQ9CSU0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rprd1bQ9CSU0 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rprd1bQ9CSU0 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rprd1bQ9CSU0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rprd1bQ9CSU0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rprd1bQ9CSU0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rprd1bQ9CSU0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rprd1bQ9CSU0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rprd1bQ9CSU0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rprd1bQ9CSU0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms