Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR46

Ska2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska2Q9CR46 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ska2Q9CR46 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ska2Q9CR46 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ska2Q9CR46 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ska2Q9CR46 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ska2Q9CR46 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ska2Q9CR46 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ska2Q9CR46 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ska2Q9CR46 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ska2Q9CR46 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ska2Q9CR46 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ska2Q9CR46 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ska2Q9CR46 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ska2Q9CR46 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ska2Q9CR46 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ska2Q9CR46 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ska2Q9CR46 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ska2Q9CR46 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ska2Q9CR46 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ska2Q9CR46 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ska2Q9CR46 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19■□□□□ 0.63
Ska2Q9CR46 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Ska2Q9CR46 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ska2Q9CR46 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ska2Q9CR46 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ska2Q9CR46 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ska2Q9CR46 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Ska2Q9CR46 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ska2Q9CR46 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ska2Q9CR46 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ska2Q9CR46 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ska2Q9CR46 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ska2Q9CR46 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ska2Q9CR46 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ska2Q9CR46 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ska2Q9CR46 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ska2Q9CR46 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ska2Q9CR46 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ska2Q9CR46 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ska2Q9CR46 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ska2Q9CR46 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ska2Q9CR46 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ska2Q9CR46 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ska2Q9CR46 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ska2Q9CR46 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ska2Q9CR46 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ska2Q9CR46 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ska2Q9CR46 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ska2Q9CR46 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ska2Q9CR46 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ska2Q9CR46 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ska2Q9CR46 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ska2Q9CR46 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ska2Q9CR46 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ska2Q9CR46 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ska2Q9CR46 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ska2Q9CR46 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ska2Q9CR46 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ska2Q9CR46 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ska2Q9CR46 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ska2Q9CR46 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ska2Q9CR46 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ska2Q9CR46 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ska2Q9CR46 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ska2Q9CR46 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ska2Q9CR46 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ska2Q9CR46 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ska2Q9CR46 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ska2Q9CR46 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ska2Q9CR46 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ska2Q9CR46 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ska2Q9CR46 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ska2Q9CR46 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ska2Q9CR46 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ska2Q9CR46 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ska2Q9CR46 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ska2Q9CR46 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ska2Q9CR46 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ska2Q9CR46 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ska2Q9CR46 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ska2Q9CR46 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ska2Q9CR46 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ska2Q9CR46 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ska2Q9CR46 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ska2Q9CR46 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ska2Q9CR46 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ska2Q9CR46 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ska2Q9CR46 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ska2Q9CR46 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ska2Q9CR46 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ska2Q9CR46 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ska2Q9CR46 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ska2Q9CR46 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ska2Q9CR46 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ska2Q9CR46 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ska2Q9CR46 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ska2Q9CR46 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ska2Q9CR46 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ska2Q9CR46 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ska2Q9CR46 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms