Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR14

Fancl, E3 ubiquitin-protein ligase FANCL, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FanclQ9CR14 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FanclQ9CR14 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FanclQ9CR14 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FanclQ9CR14 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FanclQ9CR14 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FanclQ9CR14 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FanclQ9CR14 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FanclQ9CR14 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FanclQ9CR14 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FanclQ9CR14 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FanclQ9CR14 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FanclQ9CR14 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FanclQ9CR14 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FanclQ9CR14 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FanclQ9CR14 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FanclQ9CR14 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
FanclQ9CR14 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
FanclQ9CR14 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FanclQ9CR14 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FanclQ9CR14 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FanclQ9CR14 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FanclQ9CR14 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FanclQ9CR14 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FanclQ9CR14 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FanclQ9CR14 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FanclQ9CR14 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FanclQ9CR14 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FanclQ9CR14 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FanclQ9CR14 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FanclQ9CR14 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FanclQ9CR14 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FanclQ9CR14 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC23■■□□□ 1.27
FanclQ9CR14 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FanclQ9CR14 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC23■■□□□ 1.27
FanclQ9CR14 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FanclQ9CR14 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FanclQ9CR14 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FanclQ9CR14 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FanclQ9CR14 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FanclQ9CR14 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FanclQ9CR14 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FanclQ9CR14 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FanclQ9CR14 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FanclQ9CR14 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
FanclQ9CR14 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FanclQ9CR14 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FanclQ9CR14 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FanclQ9CR14 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FanclQ9CR14 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FanclQ9CR14 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FanclQ9CR14 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FanclQ9CR14 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FanclQ9CR14 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FanclQ9CR14 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FanclQ9CR14 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FanclQ9CR14 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FanclQ9CR14 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FanclQ9CR14 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FanclQ9CR14 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FanclQ9CR14 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FanclQ9CR14 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
FanclQ9CR14 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FanclQ9CR14 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FanclQ9CR14 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FanclQ9CR14 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FanclQ9CR14 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FanclQ9CR14 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FanclQ9CR14 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FanclQ9CR14 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FanclQ9CR14 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FanclQ9CR14 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FanclQ9CR14 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FanclQ9CR14 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FanclQ9CR14 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FanclQ9CR14 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FanclQ9CR14 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FanclQ9CR14 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FanclQ9CR14 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FanclQ9CR14 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FanclQ9CR14 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FanclQ9CR14 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FanclQ9CR14 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FanclQ9CR14 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FanclQ9CR14 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FanclQ9CR14 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FanclQ9CR14 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
FanclQ9CR14 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FanclQ9CR14 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FanclQ9CR14 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FanclQ9CR14 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FanclQ9CR14 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FanclQ9CR14 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FanclQ9CR14 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FanclQ9CR14 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FanclQ9CR14 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FanclQ9CR14 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FanclQ9CR14 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FanclQ9CR14 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FanclQ9CR14 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FanclQ9CR14 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms