Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR05

4931417E11Rik, RIKEN cDNA 4931417E11, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931417E11RikQ9CR05 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4931417E11RikQ9CR05 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4931417E11RikQ9CR05 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4931417E11RikQ9CR05 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4931417E11RikQ9CR05 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
4931417E11RikQ9CR05 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
4931417E11RikQ9CR05 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4931417E11RikQ9CR05 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
4931417E11RikQ9CR05 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
4931417E11RikQ9CR05 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4931417E11RikQ9CR05 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4931417E11RikQ9CR05 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4931417E11RikQ9CR05 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4931417E11RikQ9CR05 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4931417E11RikQ9CR05 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4931417E11RikQ9CR05 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
4931417E11RikQ9CR05 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4931417E11RikQ9CR05 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4931417E11RikQ9CR05 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4931417E11RikQ9CR05 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4931417E11RikQ9CR05 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4931417E11RikQ9CR05 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4931417E11RikQ9CR05 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
4931417E11RikQ9CR05 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
4931417E11RikQ9CR05 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4931417E11RikQ9CR05 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
4931417E11RikQ9CR05 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
4931417E11RikQ9CR05 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4931417E11RikQ9CR05 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
4931417E11RikQ9CR05 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4931417E11RikQ9CR05 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4931417E11RikQ9CR05 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4931417E11RikQ9CR05 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
4931417E11RikQ9CR05 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4931417E11RikQ9CR05 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4931417E11RikQ9CR05 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4931417E11RikQ9CR05 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4931417E11RikQ9CR05 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4931417E11RikQ9CR05 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4931417E11RikQ9CR05 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
4931417E11RikQ9CR05 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4931417E11RikQ9CR05 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4931417E11RikQ9CR05 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4931417E11RikQ9CR05 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4931417E11RikQ9CR05 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
4931417E11RikQ9CR05 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
4931417E11RikQ9CR05 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
4931417E11RikQ9CR05 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
4931417E11RikQ9CR05 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4931417E11RikQ9CR05 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
4931417E11RikQ9CR05 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
4931417E11RikQ9CR05 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4931417E11RikQ9CR05 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4931417E11RikQ9CR05 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4931417E11RikQ9CR05 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4931417E11RikQ9CR05 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4931417E11RikQ9CR05 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4931417E11RikQ9CR05 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
4931417E11RikQ9CR05 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4931417E11RikQ9CR05 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
4931417E11RikQ9CR05 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4931417E11RikQ9CR05 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
4931417E11RikQ9CR05 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4931417E11RikQ9CR05 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4931417E11RikQ9CR05 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4931417E11RikQ9CR05 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4931417E11RikQ9CR05 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4931417E11RikQ9CR05 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
4931417E11RikQ9CR05 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
4931417E11RikQ9CR05 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4931417E11RikQ9CR05 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4931417E11RikQ9CR05 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4931417E11RikQ9CR05 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4931417E11RikQ9CR05 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
4931417E11RikQ9CR05 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4931417E11RikQ9CR05 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4931417E11RikQ9CR05 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4931417E11RikQ9CR05 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4931417E11RikQ9CR05 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4931417E11RikQ9CR05 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4931417E11RikQ9CR05 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4931417E11RikQ9CR05 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4931417E11RikQ9CR05 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4931417E11RikQ9CR05 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4931417E11RikQ9CR05 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4931417E11RikQ9CR05 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4931417E11RikQ9CR05 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4931417E11RikQ9CR05 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4931417E11RikQ9CR05 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4931417E11RikQ9CR05 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
4931417E11RikQ9CR05 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
4931417E11RikQ9CR05 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
4931417E11RikQ9CR05 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4931417E11RikQ9CR05 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4931417E11RikQ9CR05 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4931417E11RikQ9CR05 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
4931417E11RikQ9CR05 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4931417E11RikQ9CR05 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4931417E11RikQ9CR05 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4931417E11RikQ9CR05 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms