Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQX4

Pclaf, PCNA-associated factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PclafQ9CQX4 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PclafQ9CQX4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PclafQ9CQX4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PclafQ9CQX4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PclafQ9CQX4 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PclafQ9CQX4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PclafQ9CQX4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PclafQ9CQX4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PclafQ9CQX4 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PclafQ9CQX4 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PclafQ9CQX4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PclafQ9CQX4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PclafQ9CQX4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PclafQ9CQX4 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PclafQ9CQX4 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PclafQ9CQX4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PclafQ9CQX4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PclafQ9CQX4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PclafQ9CQX4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PclafQ9CQX4 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PclafQ9CQX4 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PclafQ9CQX4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PclafQ9CQX4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PclafQ9CQX4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PclafQ9CQX4 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PclafQ9CQX4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PclafQ9CQX4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PclafQ9CQX4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PclafQ9CQX4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PclafQ9CQX4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PclafQ9CQX4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PclafQ9CQX4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PclafQ9CQX4 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PclafQ9CQX4 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PclafQ9CQX4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PclafQ9CQX4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PclafQ9CQX4 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PclafQ9CQX4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PclafQ9CQX4 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PclafQ9CQX4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PclafQ9CQX4 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PclafQ9CQX4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PclafQ9CQX4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PclafQ9CQX4 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PclafQ9CQX4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PclafQ9CQX4 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PclafQ9CQX4 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PclafQ9CQX4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PclafQ9CQX4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PclafQ9CQX4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PclafQ9CQX4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PclafQ9CQX4 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PclafQ9CQX4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PclafQ9CQX4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PclafQ9CQX4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PclafQ9CQX4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PclafQ9CQX4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PclafQ9CQX4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PclafQ9CQX4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PclafQ9CQX4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PclafQ9CQX4 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PclafQ9CQX4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PclafQ9CQX4 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PclafQ9CQX4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PclafQ9CQX4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PclafQ9CQX4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PclafQ9CQX4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PclafQ9CQX4 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PclafQ9CQX4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PclafQ9CQX4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PclafQ9CQX4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PclafQ9CQX4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PclafQ9CQX4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PclafQ9CQX4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PclafQ9CQX4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PclafQ9CQX4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PclafQ9CQX4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PclafQ9CQX4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PclafQ9CQX4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PclafQ9CQX4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PclafQ9CQX4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PclafQ9CQX4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PclafQ9CQX4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PclafQ9CQX4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PclafQ9CQX4 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PclafQ9CQX4 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PclafQ9CQX4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PclafQ9CQX4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PclafQ9CQX4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PclafQ9CQX4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PclafQ9CQX4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PclafQ9CQX4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PclafQ9CQX4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PclafQ9CQX4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PclafQ9CQX4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PclafQ9CQX4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PclafQ9CQX4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PclafQ9CQX4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PclafQ9CQX4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PclafQ9CQX4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms