Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms