Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF4

Uncharacterized protein C6orf203 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQF4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9CQF4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9CQF4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9CQF4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9CQF4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9CQF4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9CQF4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9CQF4 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9CQF4 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9CQF4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9CQF4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9CQF4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9CQF4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9CQF4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9CQF4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9CQF4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9CQF4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9CQF4 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9CQF4 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9CQF4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9CQF4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9CQF4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9CQF4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9CQF4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9CQF4 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9CQF4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9CQF4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9CQF4 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9CQF4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9CQF4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9CQF4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9CQF4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9CQF4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9CQF4 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9CQF4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9CQF4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9CQF4 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9CQF4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9CQF4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9CQF4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9CQF4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9CQF4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9CQF4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9CQF4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9CQF4 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9CQF4 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9CQF4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9CQF4 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9CQF4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9CQF4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9CQF4 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9CQF4 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9CQF4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9CQF4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9CQF4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9CQF4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9CQF4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9CQF4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9CQF4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9CQF4 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9CQF4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9CQF4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9CQF4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9CQF4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9CQF4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9CQF4 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9CQF4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9CQF4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9CQF4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9CQF4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9CQF4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9CQF4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9CQF4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9CQF4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9CQF4 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9CQF4 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9CQF4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q9CQF4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q9CQF4 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q9CQF4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q9CQF4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q9CQF4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q9CQF4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q9CQF4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q9CQF4 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q9CQF4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9CQF4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9CQF4 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9CQF4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9CQF4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9CQF4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9CQF4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9CQF4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9CQF4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9CQF4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9CQF4 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9CQF4 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9CQF4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9CQF4 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9CQF4 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms