Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE8

RTRAF, RNA transcription, translation and transport factor protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTRAFQ9CQE8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RTRAFQ9CQE8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RTRAFQ9CQE8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms