Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE7

Ergic3, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ergic3Q9CQE7 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ergic3Q9CQE7 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ergic3Q9CQE7 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ergic3Q9CQE7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ergic3Q9CQE7 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ergic3Q9CQE7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ergic3Q9CQE7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ergic3Q9CQE7 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ergic3Q9CQE7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ergic3Q9CQE7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ergic3Q9CQE7 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ergic3Q9CQE7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ergic3Q9CQE7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ergic3Q9CQE7 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ergic3Q9CQE7 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ergic3Q9CQE7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ergic3Q9CQE7 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ergic3Q9CQE7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ergic3Q9CQE7 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ergic3Q9CQE7 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ergic3Q9CQE7 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ergic3Q9CQE7 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ergic3Q9CQE7 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ergic3Q9CQE7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ergic3Q9CQE7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ergic3Q9CQE7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ergic3Q9CQE7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ergic3Q9CQE7 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ergic3Q9CQE7 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ergic3Q9CQE7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ergic3Q9CQE7 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ergic3Q9CQE7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ergic3Q9CQE7 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ergic3Q9CQE7 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ergic3Q9CQE7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ergic3Q9CQE7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ergic3Q9CQE7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ergic3Q9CQE7 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ergic3Q9CQE7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ergic3Q9CQE7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ergic3Q9CQE7 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ergic3Q9CQE7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ergic3Q9CQE7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ergic3Q9CQE7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ergic3Q9CQE7 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ergic3Q9CQE7 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ergic3Q9CQE7 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ergic3Q9CQE7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ergic3Q9CQE7 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ergic3Q9CQE7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ergic3Q9CQE7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ergic3Q9CQE7 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ergic3Q9CQE7 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ergic3Q9CQE7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ergic3Q9CQE7 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ergic3Q9CQE7 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ergic3Q9CQE7 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ergic3Q9CQE7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ergic3Q9CQE7 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ergic3Q9CQE7 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ergic3Q9CQE7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ergic3Q9CQE7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ergic3Q9CQE7 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ergic3Q9CQE7 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ergic3Q9CQE7 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ergic3Q9CQE7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ergic3Q9CQE7 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Ergic3Q9CQE7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ergic3Q9CQE7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ergic3Q9CQE7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ergic3Q9CQE7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ergic3Q9CQE7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ergic3Q9CQE7 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ergic3Q9CQE7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ergic3Q9CQE7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ergic3Q9CQE7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ergic3Q9CQE7 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ergic3Q9CQE7 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ergic3Q9CQE7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ergic3Q9CQE7 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ergic3Q9CQE7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ergic3Q9CQE7 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ergic3Q9CQE7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ergic3Q9CQE7 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ergic3Q9CQE7 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ergic3Q9CQE7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ergic3Q9CQE7 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ergic3Q9CQE7 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ergic3Q9CQE7 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ergic3Q9CQE7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ergic3Q9CQE7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ergic3Q9CQE7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ergic3Q9CQE7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ergic3Q9CQE7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ergic3Q9CQE7 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ergic3Q9CQE7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ergic3Q9CQE7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ergic3Q9CQE7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ergic3Q9CQE7 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ergic3Q9CQE7 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms