Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA1

Trappc5, Trafficking protein particle complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc5Q9CQA1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc5Q9CQA1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc5Q9CQA1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc5Q9CQA1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc5Q9CQA1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc5Q9CQA1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc5Q9CQA1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc5Q9CQA1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc5Q9CQA1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc5Q9CQA1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc5Q9CQA1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc5Q9CQA1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc5Q9CQA1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc5Q9CQA1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc5Q9CQA1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Trappc5Q9CQA1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Trappc5Q9CQA1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc5Q9CQA1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc5Q9CQA1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc5Q9CQA1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc5Q9CQA1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc5Q9CQA1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc5Q9CQA1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc5Q9CQA1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc5Q9CQA1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc5Q9CQA1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc5Q9CQA1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc5Q9CQA1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc5Q9CQA1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc5Q9CQA1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc5Q9CQA1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc5Q9CQA1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc5Q9CQA1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc5Q9CQA1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc5Q9CQA1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc5Q9CQA1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc5Q9CQA1 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc5Q9CQA1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc5Q9CQA1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc5Q9CQA1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc5Q9CQA1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc5Q9CQA1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc5Q9CQA1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc5Q9CQA1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc5Q9CQA1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc5Q9CQA1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc5Q9CQA1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc5Q9CQA1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc5Q9CQA1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc5Q9CQA1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc5Q9CQA1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc5Q9CQA1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc5Q9CQA1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc5Q9CQA1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc5Q9CQA1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc5Q9CQA1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc5Q9CQA1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc5Q9CQA1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc5Q9CQA1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc5Q9CQA1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc5Q9CQA1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc5Q9CQA1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc5Q9CQA1 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc5Q9CQA1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc5Q9CQA1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc5Q9CQA1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc5Q9CQA1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc5Q9CQA1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc5Q9CQA1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc5Q9CQA1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc5Q9CQA1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc5Q9CQA1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc5Q9CQA1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc5Q9CQA1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc5Q9CQA1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc5Q9CQA1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc5Q9CQA1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc5Q9CQA1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc5Q9CQA1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc5Q9CQA1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc5Q9CQA1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc5Q9CQA1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc5Q9CQA1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc5Q9CQA1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc5Q9CQA1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc5Q9CQA1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc5Q9CQA1 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc5Q9CQA1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc5Q9CQA1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc5Q9CQA1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc5Q9CQA1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc5Q9CQA1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc5Q9CQA1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc5Q9CQA1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc5Q9CQA1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc5Q9CQA1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc5Q9CQA1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc5Q9CQA1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc5Q9CQA1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc5Q9CQA1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms