Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnaseh2cQ9CQ18 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnaseh2cQ9CQ18 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnaseh2cQ9CQ18 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnaseh2cQ9CQ18 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnaseh2cQ9CQ18 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnaseh2cQ9CQ18 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnaseh2cQ9CQ18 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnaseh2cQ9CQ18 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnaseh2cQ9CQ18 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnaseh2cQ9CQ18 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnaseh2cQ9CQ18 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnaseh2cQ9CQ18 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnaseh2cQ9CQ18 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnaseh2cQ9CQ18 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnaseh2cQ9CQ18 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnaseh2cQ9CQ18 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnaseh2cQ9CQ18 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnaseh2cQ9CQ18 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnaseh2cQ9CQ18 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnaseh2cQ9CQ18 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnaseh2cQ9CQ18 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnaseh2cQ9CQ18 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnaseh2cQ9CQ18 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnaseh2cQ9CQ18 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnaseh2cQ9CQ18 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnaseh2cQ9CQ18 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnaseh2cQ9CQ18 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnaseh2cQ9CQ18 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnaseh2cQ9CQ18 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnaseh2cQ9CQ18 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnaseh2cQ9CQ18 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnaseh2cQ9CQ18 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnaseh2cQ9CQ18 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnaseh2cQ9CQ18 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnaseh2cQ9CQ18 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnaseh2cQ9CQ18 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnaseh2cQ9CQ18 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnaseh2cQ9CQ18 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnaseh2cQ9CQ18 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnaseh2cQ9CQ18 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnaseh2cQ9CQ18 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnaseh2cQ9CQ18 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnaseh2cQ9CQ18 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnaseh2cQ9CQ18 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnaseh2cQ9CQ18 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnaseh2cQ9CQ18 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnaseh2cQ9CQ18 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnaseh2cQ9CQ18 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnaseh2cQ9CQ18 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms