Protein–RNA interactions for Protein: Q99N07

Ms4a6d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6D, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6dQ99N07 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a6dQ99N07 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a6dQ99N07 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a6dQ99N07 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a6dQ99N07 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a6dQ99N07 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a6dQ99N07 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a6dQ99N07 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a6dQ99N07 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a6dQ99N07 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a6dQ99N07 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a6dQ99N07 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a6dQ99N07 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ms4a6dQ99N07 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ms4a6dQ99N07 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ms4a6dQ99N07 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ms4a6dQ99N07 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ms4a6dQ99N07 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ms4a6dQ99N07 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ms4a6dQ99N07 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ms4a6dQ99N07 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ms4a6dQ99N07 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ms4a6dQ99N07 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ms4a6dQ99N07 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ms4a6dQ99N07 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ms4a6dQ99N07 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ms4a6dQ99N07 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ms4a6dQ99N07 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ms4a6dQ99N07 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ms4a6dQ99N07 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ms4a6dQ99N07 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ms4a6dQ99N07 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ms4a6dQ99N07 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ms4a6dQ99N07 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ms4a6dQ99N07 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ms4a6dQ99N07 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ms4a6dQ99N07 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ms4a6dQ99N07 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ms4a6dQ99N07 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ms4a6dQ99N07 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ms4a6dQ99N07 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ms4a6dQ99N07 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ms4a6dQ99N07 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ms4a6dQ99N07 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ms4a6dQ99N07 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ms4a6dQ99N07 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a6dQ99N07 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a6dQ99N07 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a6dQ99N07 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a6dQ99N07 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a6dQ99N07 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a6dQ99N07 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a6dQ99N07 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a6dQ99N07 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a6dQ99N07 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a6dQ99N07 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a6dQ99N07 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a6dQ99N07 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a6dQ99N07 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a6dQ99N07 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a6dQ99N07 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a6dQ99N07 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a6dQ99N07 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a6dQ99N07 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a6dQ99N07 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a6dQ99N07 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a6dQ99N07 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a6dQ99N07 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a6dQ99N07 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a6dQ99N07 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a6dQ99N07 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a6dQ99N07 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a6dQ99N07 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a6dQ99N07 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a6dQ99N07 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a6dQ99N07 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a6dQ99N07 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a6dQ99N07 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a6dQ99N07 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a6dQ99N07 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a6dQ99N07 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a6dQ99N07 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a6dQ99N07 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a6dQ99N07 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a6dQ99N07 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a6dQ99N07 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a6dQ99N07 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a6dQ99N07 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a6dQ99N07 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a6dQ99N07 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a6dQ99N07 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a6dQ99N07 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a6dQ99N07 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a6dQ99N07 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a6dQ99N07 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a6dQ99N07 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a6dQ99N07 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a6dQ99N07 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a6dQ99N07 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a6dQ99N07 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms