Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ms4a4dQ99N05 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a4dQ99N05 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a4dQ99N05 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a4dQ99N05 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a4dQ99N05 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a4dQ99N05 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a4dQ99N05 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a4dQ99N05 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a4dQ99N05 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a4dQ99N05 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a4dQ99N05 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a4dQ99N05 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a4dQ99N05 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a4dQ99N05 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a4dQ99N05 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a4dQ99N05 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a4dQ99N05 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a4dQ99N05 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a4dQ99N05 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a4dQ99N05 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a4dQ99N05 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a4dQ99N05 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a4dQ99N05 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a4dQ99N05 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a4dQ99N05 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a4dQ99N05 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a4dQ99N05 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a4dQ99N05 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a4dQ99N05 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a4dQ99N05 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a4dQ99N05 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a4dQ99N05 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a4dQ99N05 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a4dQ99N05 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a4dQ99N05 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a4dQ99N05 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a4dQ99N05 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a4dQ99N05 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a4dQ99N05 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a4dQ99N05 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a4dQ99N05 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Ms4a4dQ99N05 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a4dQ99N05 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a4dQ99N05 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a4dQ99N05 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a4dQ99N05 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a4dQ99N05 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a4dQ99N05 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a4dQ99N05 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Ms4a4dQ99N05 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ms4a4dQ99N05 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ms4a4dQ99N05 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ms4a4dQ99N05 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ms4a4dQ99N05 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ms4a4dQ99N05 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ms4a4dQ99N05 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Ms4a4dQ99N05 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Ms4a4dQ99N05 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Ms4a4dQ99N05 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ms4a4dQ99N05 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ms4a4dQ99N05 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ms4a4dQ99N05 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ms4a4dQ99N05 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ms4a4dQ99N05 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ms4a4dQ99N05 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ms4a4dQ99N05 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ms4a4dQ99N05 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ms4a4dQ99N05 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ms4a4dQ99N05 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ms4a4dQ99N05 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ms4a4dQ99N05 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ms4a4dQ99N05 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ms4a4dQ99N05 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ms4a4dQ99N05 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ms4a4dQ99N05 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ms4a4dQ99N05 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ms4a4dQ99N05 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ms4a4dQ99N05 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ms4a4dQ99N05 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ms4a4dQ99N05 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ms4a4dQ99N05 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ms4a4dQ99N05 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ms4a4dQ99N05 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ms4a4dQ99N05 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ms4a4dQ99N05 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ms4a4dQ99N05 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ms4a4dQ99N05 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ms4a4dQ99N05 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ms4a4dQ99N05 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ms4a4dQ99N05 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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