Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gdpd3Q99LY2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Gdpd3Q99LY2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gdpd3Q99LY2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gdpd3Q99LY2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gdpd3Q99LY2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gdpd3Q99LY2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gdpd3Q99LY2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gdpd3Q99LY2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gdpd3Q99LY2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gdpd3Q99LY2 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gdpd3Q99LY2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gdpd3Q99LY2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gdpd3Q99LY2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gdpd3Q99LY2 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gdpd3Q99LY2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gdpd3Q99LY2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gdpd3Q99LY2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gdpd3Q99LY2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gdpd3Q99LY2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gdpd3Q99LY2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gdpd3Q99LY2 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gdpd3Q99LY2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gdpd3Q99LY2 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gdpd3Q99LY2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gdpd3Q99LY2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gdpd3Q99LY2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gdpd3Q99LY2 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gdpd3Q99LY2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gdpd3Q99LY2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gdpd3Q99LY2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gdpd3Q99LY2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gdpd3Q99LY2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gdpd3Q99LY2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gdpd3Q99LY2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gdpd3Q99LY2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gdpd3Q99LY2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gdpd3Q99LY2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gdpd3Q99LY2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gdpd3Q99LY2 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gdpd3Q99LY2 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gdpd3Q99LY2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gdpd3Q99LY2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gdpd3Q99LY2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gdpd3Q99LY2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Gdpd3Q99LY2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gdpd3Q99LY2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gdpd3Q99LY2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gdpd3Q99LY2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gdpd3Q99LY2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gdpd3Q99LY2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gdpd3Q99LY2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gdpd3Q99LY2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gdpd3Q99LY2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gdpd3Q99LY2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gdpd3Q99LY2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gdpd3Q99LY2 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gdpd3Q99LY2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gdpd3Q99LY2 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gdpd3Q99LY2 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gdpd3Q99LY2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gdpd3Q99LY2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gdpd3Q99LY2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gdpd3Q99LY2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gdpd3Q99LY2 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gdpd3Q99LY2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gdpd3Q99LY2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gdpd3Q99LY2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gdpd3Q99LY2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gdpd3Q99LY2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gdpd3Q99LY2 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gdpd3Q99LY2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gdpd3Q99LY2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gdpd3Q99LY2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gdpd3Q99LY2 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gdpd3Q99LY2 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Gdpd3Q99LY2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gdpd3Q99LY2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gdpd3Q99LY2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gdpd3Q99LY2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gdpd3Q99LY2 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gdpd3Q99LY2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gdpd3Q99LY2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gdpd3Q99LY2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gdpd3Q99LY2 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gdpd3Q99LY2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gdpd3Q99LY2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gdpd3Q99LY2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gdpd3Q99LY2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gdpd3Q99LY2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gdpd3Q99LY2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gdpd3Q99LY2 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gdpd3Q99LY2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gdpd3Q99LY2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gdpd3Q99LY2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Gdpd3Q99LY2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gdpd3Q99LY2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gdpd3Q99LY2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gdpd3Q99LY2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gdpd3Q99LY2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms