Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Abcf2Q99LE6 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Abcf2Q99LE6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Abcf2Q99LE6 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Abcf2Q99LE6 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Abcf2Q99LE6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Abcf2Q99LE6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Abcf2Q99LE6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Abcf2Q99LE6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Abcf2Q99LE6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Abcf2Q99LE6 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Abcf2Q99LE6 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Abcf2Q99LE6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Abcf2Q99LE6 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Abcf2Q99LE6 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Abcf2Q99LE6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Abcf2Q99LE6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Abcf2Q99LE6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Abcf2Q99LE6 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Abcf2Q99LE6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Abcf2Q99LE6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Abcf2Q99LE6 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Abcf2Q99LE6 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Abcf2Q99LE6 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Abcf2Q99LE6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Abcf2Q99LE6 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Abcf2Q99LE6 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Abcf2Q99LE6 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Abcf2Q99LE6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Abcf2Q99LE6 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Abcf2Q99LE6 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Abcf2Q99LE6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Abcf2Q99LE6 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Abcf2Q99LE6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Abcf2Q99LE6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Abcf2Q99LE6 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Abcf2Q99LE6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Abcf2Q99LE6 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Abcf2Q99LE6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Abcf2Q99LE6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Abcf2Q99LE6 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Abcf2Q99LE6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Abcf2Q99LE6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Abcf2Q99LE6 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Abcf2Q99LE6 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Abcf2Q99LE6 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Abcf2Q99LE6 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Abcf2Q99LE6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Abcf2Q99LE6 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Abcf2Q99LE6 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Abcf2Q99LE6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Abcf2Q99LE6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Abcf2Q99LE6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Abcf2Q99LE6 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Abcf2Q99LE6 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Abcf2Q99LE6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Abcf2Q99LE6 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Abcf2Q99LE6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Abcf2Q99LE6 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Abcf2Q99LE6 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Abcf2Q99LE6 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Abcf2Q99LE6 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Abcf2Q99LE6 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Abcf2Q99LE6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Abcf2Q99LE6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Abcf2Q99LE6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Abcf2Q99LE6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Abcf2Q99LE6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Abcf2Q99LE6 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Abcf2Q99LE6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Abcf2Q99LE6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Abcf2Q99LE6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Abcf2Q99LE6 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Abcf2Q99LE6 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Abcf2Q99LE6 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Abcf2Q99LE6 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Abcf2Q99LE6 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Abcf2Q99LE6 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Abcf2Q99LE6 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Abcf2Q99LE6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Abcf2Q99LE6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Abcf2Q99LE6 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Abcf2Q99LE6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Abcf2Q99LE6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Abcf2Q99LE6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Abcf2Q99LE6 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Abcf2Q99LE6 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Abcf2Q99LE6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Abcf2Q99LE6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Abcf2Q99LE6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Abcf2Q99LE6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Abcf2Q99LE6 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Abcf2Q99LE6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Abcf2Q99LE6 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Abcf2Q99LE6 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Abcf2Q99LE6 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Abcf2Q99LE6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Abcf2Q99LE6 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Abcf2Q99LE6 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Abcf2Q99LE6 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms