Protein–RNA interactions for Protein: Q99KF1

Tmed9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed9Q99KF1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmed9Q99KF1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmed9Q99KF1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tmed9Q99KF1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmed9Q99KF1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmed9Q99KF1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmed9Q99KF1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmed9Q99KF1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmed9Q99KF1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmed9Q99KF1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmed9Q99KF1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmed9Q99KF1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmed9Q99KF1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmed9Q99KF1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmed9Q99KF1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmed9Q99KF1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmed9Q99KF1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmed9Q99KF1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmed9Q99KF1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmed9Q99KF1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmed9Q99KF1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmed9Q99KF1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmed9Q99KF1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmed9Q99KF1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmed9Q99KF1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmed9Q99KF1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmed9Q99KF1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmed9Q99KF1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmed9Q99KF1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmed9Q99KF1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmed9Q99KF1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmed9Q99KF1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmed9Q99KF1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmed9Q99KF1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmed9Q99KF1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmed9Q99KF1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmed9Q99KF1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmed9Q99KF1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmed9Q99KF1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmed9Q99KF1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmed9Q99KF1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmed9Q99KF1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmed9Q99KF1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmed9Q99KF1 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmed9Q99KF1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmed9Q99KF1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmed9Q99KF1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmed9Q99KF1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmed9Q99KF1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmed9Q99KF1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmed9Q99KF1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmed9Q99KF1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmed9Q99KF1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmed9Q99KF1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmed9Q99KF1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmed9Q99KF1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmed9Q99KF1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmed9Q99KF1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmed9Q99KF1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmed9Q99KF1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmed9Q99KF1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmed9Q99KF1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmed9Q99KF1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmed9Q99KF1 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmed9Q99KF1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmed9Q99KF1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmed9Q99KF1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmed9Q99KF1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmed9Q99KF1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmed9Q99KF1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmed9Q99KF1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmed9Q99KF1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmed9Q99KF1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmed9Q99KF1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmed9Q99KF1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmed9Q99KF1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmed9Q99KF1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmed9Q99KF1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmed9Q99KF1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmed9Q99KF1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmed9Q99KF1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmed9Q99KF1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmed9Q99KF1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmed9Q99KF1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmed9Q99KF1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmed9Q99KF1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmed9Q99KF1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmed9Q99KF1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmed9Q99KF1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmed9Q99KF1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmed9Q99KF1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmed9Q99KF1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmed9Q99KF1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmed9Q99KF1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmed9Q99KF1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmed9Q99KF1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmed9Q99KF1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmed9Q99KF1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmed9Q99KF1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmed9Q99KF1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms