Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Lims1Q99JW4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lims1Q99JW4 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lims1Q99JW4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lims1Q99JW4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lims1Q99JW4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lims1Q99JW4 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Lims1Q99JW4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lims1Q99JW4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lims1Q99JW4 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lims1Q99JW4 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Lims1Q99JW4 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lims1Q99JW4 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lims1Q99JW4 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lims1Q99JW4 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lims1Q99JW4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lims1Q99JW4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lims1Q99JW4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lims1Q99JW4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lims1Q99JW4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lims1Q99JW4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lims1Q99JW4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lims1Q99JW4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lims1Q99JW4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lims1Q99JW4 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Lims1Q99JW4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lims1Q99JW4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lims1Q99JW4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lims1Q99JW4 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lims1Q99JW4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lims1Q99JW4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lims1Q99JW4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lims1Q99JW4 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lims1Q99JW4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lims1Q99JW4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lims1Q99JW4 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lims1Q99JW4 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lims1Q99JW4 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lims1Q99JW4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lims1Q99JW4 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Lims1Q99JW4 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lims1Q99JW4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lims1Q99JW4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lims1Q99JW4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lims1Q99JW4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lims1Q99JW4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lims1Q99JW4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lims1Q99JW4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Lims1Q99JW4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lims1Q99JW4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lims1Q99JW4 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lims1Q99JW4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lims1Q99JW4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lims1Q99JW4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lims1Q99JW4 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lims1Q99JW4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lims1Q99JW4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lims1Q99JW4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lims1Q99JW4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lims1Q99JW4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lims1Q99JW4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lims1Q99JW4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lims1Q99JW4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lims1Q99JW4 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lims1Q99JW4 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lims1Q99JW4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lims1Q99JW4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lims1Q99JW4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lims1Q99JW4 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lims1Q99JW4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lims1Q99JW4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lims1Q99JW4 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lims1Q99JW4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lims1Q99JW4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lims1Q99JW4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lims1Q99JW4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lims1Q99JW4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lims1Q99JW4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lims1Q99JW4 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lims1Q99JW4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Lims1Q99JW4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lims1Q99JW4 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lims1Q99JW4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lims1Q99JW4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lims1Q99JW4 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lims1Q99JW4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lims1Q99JW4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lims1Q99JW4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lims1Q99JW4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lims1Q99JW4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lims1Q99JW4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lims1Q99JW4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lims1Q99JW4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lims1Q99JW4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lims1Q99JW4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Lims1Q99JW4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lims1Q99JW4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lims1Q99JW4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Lims1Q99JW4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lims1Q99JW4 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms