Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Apobec3Q99J72 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Apobec3Q99J72 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Apobec3Q99J72 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Apobec3Q99J72 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Apobec3Q99J72 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Apobec3Q99J72 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Apobec3Q99J72 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Apobec3Q99J72 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Apobec3Q99J72 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Apobec3Q99J72 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Apobec3Q99J72 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Apobec3Q99J72 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Apobec3Q99J72 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Apobec3Q99J72 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Apobec3Q99J72 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Apobec3Q99J72 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Apobec3Q99J72 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Apobec3Q99J72 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Apobec3Q99J72 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Apobec3Q99J72 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Apobec3Q99J72 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Apobec3Q99J72 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Apobec3Q99J72 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Apobec3Q99J72 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Apobec3Q99J72 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Apobec3Q99J72 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Apobec3Q99J72 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Apobec3Q99J72 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Apobec3Q99J72 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Apobec3Q99J72 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Apobec3Q99J72 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Apobec3Q99J72 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Apobec3Q99J72 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Apobec3Q99J72 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Apobec3Q99J72 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Apobec3Q99J72 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Apobec3Q99J72 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Apobec3Q99J72 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Apobec3Q99J72 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Apobec3Q99J72 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Apobec3Q99J72 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Apobec3Q99J72 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Apobec3Q99J72 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Apobec3Q99J72 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Apobec3Q99J72 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Apobec3Q99J72 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Apobec3Q99J72 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Apobec3Q99J72 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Apobec3Q99J72 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Apobec3Q99J72 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Apobec3Q99J72 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Apobec3Q99J72 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Apobec3Q99J72 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Apobec3Q99J72 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Apobec3Q99J72 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Apobec3Q99J72 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Apobec3Q99J72 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Apobec3Q99J72 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Apobec3Q99J72 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Apobec3Q99J72 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Apobec3Q99J72 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Apobec3Q99J72 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Apobec3Q99J72 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Apobec3Q99J72 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Apobec3Q99J72 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Apobec3Q99J72 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Apobec3Q99J72 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Apobec3Q99J72 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Apobec3Q99J72 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Apobec3Q99J72 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Apobec3Q99J72 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Apobec3Q99J72 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Apobec3Q99J72 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Apobec3Q99J72 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Apobec3Q99J72 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Apobec3Q99J72 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Apobec3Q99J72 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Apobec3Q99J72 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Apobec3Q99J72 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Apobec3Q99J72 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Apobec3Q99J72 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Apobec3Q99J72 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Apobec3Q99J72 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Apobec3Q99J72 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Apobec3Q99J72 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Apobec3Q99J72 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Apobec3Q99J72 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Apobec3Q99J72 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Apobec3Q99J72 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Apobec3Q99J72 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Apobec3Q99J72 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Apobec3Q99J72 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Apobec3Q99J72 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Apobec3Q99J72 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Apobec3Q99J72 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Apobec3Q99J72 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Apobec3Q99J72 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Apobec3Q99J72 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Apobec3Q99J72 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms