Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ctu1Q99J10 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ctu1Q99J10 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ctu1Q99J10 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ctu1Q99J10 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ctu1Q99J10 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ctu1Q99J10 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ctu1Q99J10 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ctu1Q99J10 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ctu1Q99J10 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ctu1Q99J10 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ctu1Q99J10 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ctu1Q99J10 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ctu1Q99J10 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ctu1Q99J10 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Ctu1Q99J10 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ctu1Q99J10 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Ctu1Q99J10 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ctu1Q99J10 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ctu1Q99J10 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ctu1Q99J10 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ctu1Q99J10 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ctu1Q99J10 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ctu1Q99J10 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ctu1Q99J10 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ctu1Q99J10 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ctu1Q99J10 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ctu1Q99J10 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ctu1Q99J10 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ctu1Q99J10 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ctu1Q99J10 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ctu1Q99J10 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ctu1Q99J10 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ctu1Q99J10 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Ctu1Q99J10 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ctu1Q99J10 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ctu1Q99J10 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ctu1Q99J10 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ctu1Q99J10 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ctu1Q99J10 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ctu1Q99J10 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ctu1Q99J10 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ctu1Q99J10 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ctu1Q99J10 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Ctu1Q99J10 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ctu1Q99J10 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Ctu1Q99J10 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ctu1Q99J10 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ctu1Q99J10 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ctu1Q99J10 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ctu1Q99J10 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ctu1Q99J10 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ctu1Q99J10 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ctu1Q99J10 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ctu1Q99J10 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ctu1Q99J10 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ctu1Q99J10 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Ctu1Q99J10 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ctu1Q99J10 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ctu1Q99J10 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ctu1Q99J10 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ctu1Q99J10 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ctu1Q99J10 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ctu1Q99J10 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Ctu1Q99J10 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ctu1Q99J10 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ctu1Q99J10 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ctu1Q99J10 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ctu1Q99J10 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ctu1Q99J10 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ctu1Q99J10 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ctu1Q99J10 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ctu1Q99J10 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ctu1Q99J10 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ctu1Q99J10 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ctu1Q99J10 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ctu1Q99J10 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ctu1Q99J10 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ctu1Q99J10 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ctu1Q99J10 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ctu1Q99J10 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ctu1Q99J10 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ctu1Q99J10 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ctu1Q99J10 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ctu1Q99J10 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ctu1Q99J10 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ctu1Q99J10 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ctu1Q99J10 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ctu1Q99J10 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Ctu1Q99J10 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ctu1Q99J10 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ctu1Q99J10 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ctu1Q99J10 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ctu1Q99J10 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Ctu1Q99J10 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ctu1Q99J10 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ctu1Q99J10 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ctu1Q99J10 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ctu1Q99J10 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ctu1Q99J10 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
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