Protein–RNA interactions for Protein: Q924T3

Xrcc4, DNA repair protein XRCC4, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc4Q924T3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Xrcc4Q924T3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Xrcc4Q924T3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Xrcc4Q924T3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Xrcc4Q924T3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Xrcc4Q924T3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Xrcc4Q924T3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Xrcc4Q924T3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Xrcc4Q924T3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Xrcc4Q924T3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Xrcc4Q924T3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Xrcc4Q924T3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Xrcc4Q924T3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Xrcc4Q924T3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Xrcc4Q924T3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Xrcc4Q924T3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Xrcc4Q924T3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Xrcc4Q924T3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Xrcc4Q924T3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Xrcc4Q924T3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Xrcc4Q924T3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Xrcc4Q924T3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Xrcc4Q924T3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Xrcc4Q924T3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Xrcc4Q924T3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Xrcc4Q924T3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Xrcc4Q924T3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Xrcc4Q924T3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Xrcc4Q924T3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Xrcc4Q924T3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Xrcc4Q924T3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Xrcc4Q924T3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Xrcc4Q924T3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Xrcc4Q924T3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Xrcc4Q924T3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Xrcc4Q924T3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Xrcc4Q924T3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Xrcc4Q924T3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Xrcc4Q924T3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Xrcc4Q924T3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Xrcc4Q924T3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Xrcc4Q924T3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Xrcc4Q924T3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Xrcc4Q924T3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Xrcc4Q924T3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Xrcc4Q924T3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Xrcc4Q924T3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Xrcc4Q924T3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Xrcc4Q924T3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Xrcc4Q924T3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Xrcc4Q924T3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Xrcc4Q924T3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Xrcc4Q924T3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Xrcc4Q924T3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Xrcc4Q924T3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Xrcc4Q924T3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Xrcc4Q924T3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Xrcc4Q924T3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Xrcc4Q924T3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Xrcc4Q924T3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Xrcc4Q924T3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Xrcc4Q924T3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Xrcc4Q924T3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Xrcc4Q924T3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Xrcc4Q924T3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Xrcc4Q924T3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Xrcc4Q924T3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Xrcc4Q924T3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Xrcc4Q924T3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Xrcc4Q924T3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Xrcc4Q924T3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Xrcc4Q924T3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Xrcc4Q924T3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Xrcc4Q924T3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Xrcc4Q924T3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Xrcc4Q924T3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Xrcc4Q924T3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Xrcc4Q924T3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Xrcc4Q924T3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Xrcc4Q924T3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Xrcc4Q924T3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Xrcc4Q924T3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Xrcc4Q924T3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Xrcc4Q924T3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Xrcc4Q924T3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Xrcc4Q924T3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Xrcc4Q924T3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Xrcc4Q924T3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Xrcc4Q924T3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Xrcc4Q924T3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Xrcc4Q924T3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Xrcc4Q924T3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Xrcc4Q924T3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Xrcc4Q924T3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Xrcc4Q924T3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Xrcc4Q924T3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Xrcc4Q924T3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Xrcc4Q924T3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Xrcc4Q924T3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Xrcc4Q924T3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms