Protein–RNA interactions for Protein: Q924P3

Lcn8, Epididymal-specific lipocalin-8, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn8Q924P3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lcn8Q924P3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lcn8Q924P3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lcn8Q924P3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lcn8Q924P3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lcn8Q924P3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lcn8Q924P3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lcn8Q924P3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lcn8Q924P3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Lcn8Q924P3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lcn8Q924P3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Lcn8Q924P3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lcn8Q924P3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lcn8Q924P3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lcn8Q924P3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Lcn8Q924P3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
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Lcn8Q924P3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lcn8Q924P3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Lcn8Q924P3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Lcn8Q924P3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Lcn8Q924P3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lcn8Q924P3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Lcn8Q924P3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lcn8Q924P3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lcn8Q924P3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Lcn8Q924P3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lcn8Q924P3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lcn8Q924P3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lcn8Q924P3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lcn8Q924P3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lcn8Q924P3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lcn8Q924P3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lcn8Q924P3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Lcn8Q924P3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms