Protein–RNA interactions for Protein: Q921I6

Sh3bp4, SH3 domain-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp4Q921I6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh3bp4Q921I6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh3bp4Q921I6 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh3bp4Q921I6 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh3bp4Q921I6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh3bp4Q921I6 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh3bp4Q921I6 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh3bp4Q921I6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh3bp4Q921I6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh3bp4Q921I6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh3bp4Q921I6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh3bp4Q921I6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh3bp4Q921I6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh3bp4Q921I6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh3bp4Q921I6 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh3bp4Q921I6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh3bp4Q921I6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh3bp4Q921I6 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh3bp4Q921I6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh3bp4Q921I6 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh3bp4Q921I6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh3bp4Q921I6 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh3bp4Q921I6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sh3bp4Q921I6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sh3bp4Q921I6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sh3bp4Q921I6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sh3bp4Q921I6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sh3bp4Q921I6 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sh3bp4Q921I6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sh3bp4Q921I6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sh3bp4Q921I6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sh3bp4Q921I6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sh3bp4Q921I6 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Sh3bp4Q921I6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Sh3bp4Q921I6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sh3bp4Q921I6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Sh3bp4Q921I6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sh3bp4Q921I6 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sh3bp4Q921I6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sh3bp4Q921I6 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sh3bp4Q921I6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Sh3bp4Q921I6 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sh3bp4Q921I6 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sh3bp4Q921I6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sh3bp4Q921I6 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh3bp4Q921I6 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh3bp4Q921I6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh3bp4Q921I6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh3bp4Q921I6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh3bp4Q921I6 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh3bp4Q921I6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh3bp4Q921I6 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh3bp4Q921I6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh3bp4Q921I6 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh3bp4Q921I6 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh3bp4Q921I6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh3bp4Q921I6 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh3bp4Q921I6 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh3bp4Q921I6 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh3bp4Q921I6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh3bp4Q921I6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh3bp4Q921I6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh3bp4Q921I6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh3bp4Q921I6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh3bp4Q921I6 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh3bp4Q921I6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh3bp4Q921I6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh3bp4Q921I6 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh3bp4Q921I6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh3bp4Q921I6 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh3bp4Q921I6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh3bp4Q921I6 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh3bp4Q921I6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh3bp4Q921I6 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh3bp4Q921I6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh3bp4Q921I6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh3bp4Q921I6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh3bp4Q921I6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh3bp4Q921I6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh3bp4Q921I6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh3bp4Q921I6 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh3bp4Q921I6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh3bp4Q921I6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh3bp4Q921I6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh3bp4Q921I6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh3bp4Q921I6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh3bp4Q921I6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh3bp4Q921I6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh3bp4Q921I6 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh3bp4Q921I6 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3bp4Q921I6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3bp4Q921I6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3bp4Q921I6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3bp4Q921I6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3bp4Q921I6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3bp4Q921I6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3bp4Q921I6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3bp4Q921I6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3bp4Q921I6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3bp4Q921I6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms