Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHW2

Cacng8, Voltage-dependent calcium channel gamma-8 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng8Q8VHW2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cacng8Q8VHW2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cacng8Q8VHW2 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cacng8Q8VHW2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cacng8Q8VHW2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cacng8Q8VHW2 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cacng8Q8VHW2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cacng8Q8VHW2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cacng8Q8VHW2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cacng8Q8VHW2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cacng8Q8VHW2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cacng8Q8VHW2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cacng8Q8VHW2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cacng8Q8VHW2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cacng8Q8VHW2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cacng8Q8VHW2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cacng8Q8VHW2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cacng8Q8VHW2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cacng8Q8VHW2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cacng8Q8VHW2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cacng8Q8VHW2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cacng8Q8VHW2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cacng8Q8VHW2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cacng8Q8VHW2 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cacng8Q8VHW2 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cacng8Q8VHW2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacng8Q8VHW2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacng8Q8VHW2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacng8Q8VHW2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacng8Q8VHW2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacng8Q8VHW2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacng8Q8VHW2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacng8Q8VHW2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacng8Q8VHW2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacng8Q8VHW2 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacng8Q8VHW2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacng8Q8VHW2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacng8Q8VHW2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacng8Q8VHW2 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacng8Q8VHW2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacng8Q8VHW2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacng8Q8VHW2 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacng8Q8VHW2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacng8Q8VHW2 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacng8Q8VHW2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacng8Q8VHW2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacng8Q8VHW2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacng8Q8VHW2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacng8Q8VHW2 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacng8Q8VHW2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacng8Q8VHW2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacng8Q8VHW2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacng8Q8VHW2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacng8Q8VHW2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacng8Q8VHW2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacng8Q8VHW2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacng8Q8VHW2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacng8Q8VHW2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacng8Q8VHW2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacng8Q8VHW2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacng8Q8VHW2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacng8Q8VHW2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacng8Q8VHW2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacng8Q8VHW2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacng8Q8VHW2 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacng8Q8VHW2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacng8Q8VHW2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacng8Q8VHW2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacng8Q8VHW2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacng8Q8VHW2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacng8Q8VHW2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacng8Q8VHW2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacng8Q8VHW2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacng8Q8VHW2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacng8Q8VHW2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacng8Q8VHW2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacng8Q8VHW2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacng8Q8VHW2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacng8Q8VHW2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacng8Q8VHW2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacng8Q8VHW2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacng8Q8VHW2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacng8Q8VHW2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacng8Q8VHW2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacng8Q8VHW2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacng8Q8VHW2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacng8Q8VHW2 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacng8Q8VHW2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacng8Q8VHW2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacng8Q8VHW2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacng8Q8VHW2 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacng8Q8VHW2 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacng8Q8VHW2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacng8Q8VHW2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacng8Q8VHW2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacng8Q8VHW2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacng8Q8VHW2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacng8Q8VHW2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacng8Q8VHW2 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacng8Q8VHW2 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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