Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ9

Vps4a, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps4aQ8VEJ9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vps4aQ8VEJ9 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vps4aQ8VEJ9 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vps4aQ8VEJ9 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vps4aQ8VEJ9 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vps4aQ8VEJ9 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vps4aQ8VEJ9 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vps4aQ8VEJ9 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vps4aQ8VEJ9 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vps4aQ8VEJ9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vps4aQ8VEJ9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vps4aQ8VEJ9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vps4aQ8VEJ9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vps4aQ8VEJ9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vps4aQ8VEJ9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vps4aQ8VEJ9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vps4aQ8VEJ9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vps4aQ8VEJ9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vps4aQ8VEJ9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vps4aQ8VEJ9 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vps4aQ8VEJ9 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vps4aQ8VEJ9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vps4aQ8VEJ9 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vps4aQ8VEJ9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vps4aQ8VEJ9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vps4aQ8VEJ9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vps4aQ8VEJ9 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vps4aQ8VEJ9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Vps4aQ8VEJ9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vps4aQ8VEJ9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vps4aQ8VEJ9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vps4aQ8VEJ9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vps4aQ8VEJ9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vps4aQ8VEJ9 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vps4aQ8VEJ9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vps4aQ8VEJ9 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vps4aQ8VEJ9 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vps4aQ8VEJ9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vps4aQ8VEJ9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vps4aQ8VEJ9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vps4aQ8VEJ9 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vps4aQ8VEJ9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vps4aQ8VEJ9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Vps4aQ8VEJ9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vps4aQ8VEJ9 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vps4aQ8VEJ9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vps4aQ8VEJ9 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vps4aQ8VEJ9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vps4aQ8VEJ9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vps4aQ8VEJ9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Vps4aQ8VEJ9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vps4aQ8VEJ9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vps4aQ8VEJ9 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Vps4aQ8VEJ9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vps4aQ8VEJ9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vps4aQ8VEJ9 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vps4aQ8VEJ9 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vps4aQ8VEJ9 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vps4aQ8VEJ9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vps4aQ8VEJ9 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vps4aQ8VEJ9 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vps4aQ8VEJ9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vps4aQ8VEJ9 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vps4aQ8VEJ9 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vps4aQ8VEJ9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vps4aQ8VEJ9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vps4aQ8VEJ9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vps4aQ8VEJ9 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vps4aQ8VEJ9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vps4aQ8VEJ9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vps4aQ8VEJ9 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Vps4aQ8VEJ9 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vps4aQ8VEJ9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vps4aQ8VEJ9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vps4aQ8VEJ9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Vps4aQ8VEJ9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vps4aQ8VEJ9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vps4aQ8VEJ9 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vps4aQ8VEJ9 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vps4aQ8VEJ9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vps4aQ8VEJ9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vps4aQ8VEJ9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vps4aQ8VEJ9 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vps4aQ8VEJ9 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vps4aQ8VEJ9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vps4aQ8VEJ9 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Vps4aQ8VEJ9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vps4aQ8VEJ9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vps4aQ8VEJ9 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vps4aQ8VEJ9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vps4aQ8VEJ9 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vps4aQ8VEJ9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vps4aQ8VEJ9 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vps4aQ8VEJ9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vps4aQ8VEJ9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vps4aQ8VEJ9 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vps4aQ8VEJ9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vps4aQ8VEJ9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vps4aQ8VEJ9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vps4aQ8VEJ9 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms