Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE97

Srsf4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf4Q8VE97 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Srsf4Q8VE97 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Srsf4Q8VE97 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srsf4Q8VE97 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srsf4Q8VE97 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srsf4Q8VE97 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srsf4Q8VE97 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srsf4Q8VE97 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srsf4Q8VE97 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srsf4Q8VE97 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srsf4Q8VE97 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srsf4Q8VE97 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srsf4Q8VE97 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srsf4Q8VE97 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srsf4Q8VE97 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srsf4Q8VE97 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srsf4Q8VE97 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srsf4Q8VE97 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srsf4Q8VE97 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srsf4Q8VE97 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srsf4Q8VE97 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srsf4Q8VE97 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srsf4Q8VE97 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srsf4Q8VE97 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srsf4Q8VE97 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srsf4Q8VE97 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Srsf4Q8VE97 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Srsf4Q8VE97 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Srsf4Q8VE97 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Srsf4Q8VE97 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Srsf4Q8VE97 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Srsf4Q8VE97 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Srsf4Q8VE97 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Srsf4Q8VE97 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Srsf4Q8VE97 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Srsf4Q8VE97 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Srsf4Q8VE97 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Srsf4Q8VE97 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Srsf4Q8VE97 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Srsf4Q8VE97 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Srsf4Q8VE97 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srsf4Q8VE97 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srsf4Q8VE97 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srsf4Q8VE97 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srsf4Q8VE97 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srsf4Q8VE97 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srsf4Q8VE97 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srsf4Q8VE97 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srsf4Q8VE97 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srsf4Q8VE97 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srsf4Q8VE97 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srsf4Q8VE97 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srsf4Q8VE97 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srsf4Q8VE97 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srsf4Q8VE97 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srsf4Q8VE97 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srsf4Q8VE97 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srsf4Q8VE97 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Srsf4Q8VE97 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srsf4Q8VE97 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srsf4Q8VE97 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srsf4Q8VE97 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srsf4Q8VE97 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srsf4Q8VE97 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Srsf4Q8VE97 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srsf4Q8VE97 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srsf4Q8VE97 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srsf4Q8VE97 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Srsf4Q8VE97 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srsf4Q8VE97 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srsf4Q8VE97 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srsf4Q8VE97 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srsf4Q8VE97 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srsf4Q8VE97 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srsf4Q8VE97 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srsf4Q8VE97 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srsf4Q8VE97 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srsf4Q8VE97 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srsf4Q8VE97 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srsf4Q8VE97 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srsf4Q8VE97 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srsf4Q8VE97 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srsf4Q8VE97 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Srsf4Q8VE97 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Srsf4Q8VE97 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Srsf4Q8VE97 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Srsf4Q8VE97 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Srsf4Q8VE97 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Srsf4Q8VE97 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Srsf4Q8VE97 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Srsf4Q8VE97 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Srsf4Q8VE97 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Srsf4Q8VE97 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Srsf4Q8VE97 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Srsf4Q8VE97 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Srsf4Q8VE97 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Srsf4Q8VE97 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Srsf4Q8VE97 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Srsf4Q8VE97 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Srsf4Q8VE97 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms