Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDG3

Parn, Poly(A)-specific ribonuclease PARN, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParnQ8VDG3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ParnQ8VDG3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ParnQ8VDG3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ParnQ8VDG3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ParnQ8VDG3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ParnQ8VDG3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ParnQ8VDG3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ParnQ8VDG3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ParnQ8VDG3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ParnQ8VDG3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ParnQ8VDG3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ParnQ8VDG3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ParnQ8VDG3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ParnQ8VDG3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ParnQ8VDG3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ParnQ8VDG3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ParnQ8VDG3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ParnQ8VDG3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ParnQ8VDG3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ParnQ8VDG3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ParnQ8VDG3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ParnQ8VDG3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ParnQ8VDG3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ParnQ8VDG3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ParnQ8VDG3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ParnQ8VDG3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ParnQ8VDG3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ParnQ8VDG3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ParnQ8VDG3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ParnQ8VDG3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ParnQ8VDG3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ParnQ8VDG3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ParnQ8VDG3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ParnQ8VDG3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ParnQ8VDG3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ParnQ8VDG3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ParnQ8VDG3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ParnQ8VDG3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ParnQ8VDG3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ParnQ8VDG3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ParnQ8VDG3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ParnQ8VDG3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ParnQ8VDG3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ParnQ8VDG3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ParnQ8VDG3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ParnQ8VDG3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ParnQ8VDG3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ParnQ8VDG3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ParnQ8VDG3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ParnQ8VDG3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ParnQ8VDG3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ParnQ8VDG3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ParnQ8VDG3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ParnQ8VDG3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ParnQ8VDG3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ParnQ8VDG3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ParnQ8VDG3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ParnQ8VDG3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ParnQ8VDG3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ParnQ8VDG3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ParnQ8VDG3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ParnQ8VDG3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ParnQ8VDG3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ParnQ8VDG3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ParnQ8VDG3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ParnQ8VDG3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ParnQ8VDG3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ParnQ8VDG3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ParnQ8VDG3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ParnQ8VDG3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ParnQ8VDG3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ParnQ8VDG3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ParnQ8VDG3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ParnQ8VDG3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ParnQ8VDG3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ParnQ8VDG3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ParnQ8VDG3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ParnQ8VDG3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ParnQ8VDG3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ParnQ8VDG3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ParnQ8VDG3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ParnQ8VDG3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ParnQ8VDG3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ParnQ8VDG3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ParnQ8VDG3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ParnQ8VDG3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ParnQ8VDG3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ParnQ8VDG3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ParnQ8VDG3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ParnQ8VDG3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ParnQ8VDG3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ParnQ8VDG3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ParnQ8VDG3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ParnQ8VDG3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ParnQ8VDG3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ParnQ8VDG3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ParnQ8VDG3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ParnQ8VDG3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ParnQ8VDG3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ParnQ8VDG3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms