Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBX6

Mpdz, Multiple PDZ domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MpdzQ8VBX6 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MpdzQ8VBX6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MpdzQ8VBX6 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MpdzQ8VBX6 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MpdzQ8VBX6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MpdzQ8VBX6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MpdzQ8VBX6 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MpdzQ8VBX6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MpdzQ8VBX6 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MpdzQ8VBX6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MpdzQ8VBX6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MpdzQ8VBX6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MpdzQ8VBX6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MpdzQ8VBX6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MpdzQ8VBX6 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MpdzQ8VBX6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MpdzQ8VBX6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MpdzQ8VBX6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MpdzQ8VBX6 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MpdzQ8VBX6 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MpdzQ8VBX6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MpdzQ8VBX6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MpdzQ8VBX6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MpdzQ8VBX6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MpdzQ8VBX6 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
MpdzQ8VBX6 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MpdzQ8VBX6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MpdzQ8VBX6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MpdzQ8VBX6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MpdzQ8VBX6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MpdzQ8VBX6 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MpdzQ8VBX6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MpdzQ8VBX6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MpdzQ8VBX6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
MpdzQ8VBX6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MpdzQ8VBX6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MpdzQ8VBX6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MpdzQ8VBX6 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MpdzQ8VBX6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
MpdzQ8VBX6 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MpdzQ8VBX6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
MpdzQ8VBX6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MpdzQ8VBX6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MpdzQ8VBX6 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MpdzQ8VBX6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
MpdzQ8VBX6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
MpdzQ8VBX6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MpdzQ8VBX6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MpdzQ8VBX6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MpdzQ8VBX6 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MpdzQ8VBX6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MpdzQ8VBX6 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MpdzQ8VBX6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MpdzQ8VBX6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MpdzQ8VBX6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MpdzQ8VBX6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MpdzQ8VBX6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MpdzQ8VBX6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MpdzQ8VBX6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MpdzQ8VBX6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MpdzQ8VBX6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MpdzQ8VBX6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MpdzQ8VBX6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MpdzQ8VBX6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MpdzQ8VBX6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MpdzQ8VBX6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MpdzQ8VBX6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MpdzQ8VBX6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MpdzQ8VBX6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MpdzQ8VBX6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MpdzQ8VBX6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MpdzQ8VBX6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MpdzQ8VBX6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MpdzQ8VBX6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MpdzQ8VBX6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MpdzQ8VBX6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MpdzQ8VBX6 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MpdzQ8VBX6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MpdzQ8VBX6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MpdzQ8VBX6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MpdzQ8VBX6 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
MpdzQ8VBX6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MpdzQ8VBX6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MpdzQ8VBX6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MpdzQ8VBX6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MpdzQ8VBX6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MpdzQ8VBX6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
MpdzQ8VBX6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MpdzQ8VBX6 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MpdzQ8VBX6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MpdzQ8VBX6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MpdzQ8VBX6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MpdzQ8VBX6 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
MpdzQ8VBX6 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
MpdzQ8VBX6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MpdzQ8VBX6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MpdzQ8VBX6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MpdzQ8VBX6 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MpdzQ8VBX6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MpdzQ8VBX6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms