Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ApobrQ8VBT6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ApobrQ8VBT6 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ApobrQ8VBT6 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ApobrQ8VBT6 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ApobrQ8VBT6 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ApobrQ8VBT6 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ApobrQ8VBT6 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ApobrQ8VBT6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ApobrQ8VBT6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ApobrQ8VBT6 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ApobrQ8VBT6 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ApobrQ8VBT6 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ApobrQ8VBT6 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ApobrQ8VBT6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ApobrQ8VBT6 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ApobrQ8VBT6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ApobrQ8VBT6 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ApobrQ8VBT6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ApobrQ8VBT6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ApobrQ8VBT6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ApobrQ8VBT6 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ApobrQ8VBT6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ApobrQ8VBT6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ApobrQ8VBT6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ApobrQ8VBT6 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ApobrQ8VBT6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ApobrQ8VBT6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ApobrQ8VBT6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ApobrQ8VBT6 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ApobrQ8VBT6 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ApobrQ8VBT6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ApobrQ8VBT6 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ApobrQ8VBT6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ApobrQ8VBT6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ApobrQ8VBT6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ApobrQ8VBT6 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ApobrQ8VBT6 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ApobrQ8VBT6 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ApobrQ8VBT6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ApobrQ8VBT6 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ApobrQ8VBT6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ApobrQ8VBT6 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ApobrQ8VBT6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ApobrQ8VBT6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ApobrQ8VBT6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ApobrQ8VBT6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ApobrQ8VBT6 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ApobrQ8VBT6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ApobrQ8VBT6 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ApobrQ8VBT6 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ApobrQ8VBT6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ApobrQ8VBT6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ApobrQ8VBT6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ApobrQ8VBT6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ApobrQ8VBT6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ApobrQ8VBT6 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ApobrQ8VBT6 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ApobrQ8VBT6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ApobrQ8VBT6 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ApobrQ8VBT6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ApobrQ8VBT6 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ApobrQ8VBT6 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ApobrQ8VBT6 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ApobrQ8VBT6 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ApobrQ8VBT6 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ApobrQ8VBT6 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ApobrQ8VBT6 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ApobrQ8VBT6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ApobrQ8VBT6 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ApobrQ8VBT6 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ApobrQ8VBT6 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ApobrQ8VBT6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ApobrQ8VBT6 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ApobrQ8VBT6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ApobrQ8VBT6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ApobrQ8VBT6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ApobrQ8VBT6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ApobrQ8VBT6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ApobrQ8VBT6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ApobrQ8VBT6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ApobrQ8VBT6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ApobrQ8VBT6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ApobrQ8VBT6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ApobrQ8VBT6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ApobrQ8VBT6 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ApobrQ8VBT6 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ApobrQ8VBT6 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ApobrQ8VBT6 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ApobrQ8VBT6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ApobrQ8VBT6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ApobrQ8VBT6 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ApobrQ8VBT6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ApobrQ8VBT6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ApobrQ8VBT6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ApobrQ8VBT6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ApobrQ8VBT6 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ApobrQ8VBT6 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ApobrQ8VBT6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ApobrQ8VBT6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms