Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxc12Q8K5B8 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxc12Q8K5B8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxc12Q8K5B8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxc12Q8K5B8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxc12Q8K5B8 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxc12Q8K5B8 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxc12Q8K5B8 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxc12Q8K5B8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxc12Q8K5B8 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxc12Q8K5B8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxc12Q8K5B8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxc12Q8K5B8 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxc12Q8K5B8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxc12Q8K5B8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxc12Q8K5B8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxc12Q8K5B8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxc12Q8K5B8 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxc12Q8K5B8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxc12Q8K5B8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxc12Q8K5B8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxc12Q8K5B8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxc12Q8K5B8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Hoxc12Q8K5B8 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc12Q8K5B8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc12Q8K5B8 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc12Q8K5B8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc12Q8K5B8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc12Q8K5B8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc12Q8K5B8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc12Q8K5B8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc12Q8K5B8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc12Q8K5B8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc12Q8K5B8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc12Q8K5B8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc12Q8K5B8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc12Q8K5B8 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc12Q8K5B8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc12Q8K5B8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc12Q8K5B8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc12Q8K5B8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc12Q8K5B8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc12Q8K5B8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc12Q8K5B8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc12Q8K5B8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc12Q8K5B8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc12Q8K5B8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc12Q8K5B8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc12Q8K5B8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc12Q8K5B8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc12Q8K5B8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc12Q8K5B8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc12Q8K5B8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc12Q8K5B8 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc12Q8K5B8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc12Q8K5B8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc12Q8K5B8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc12Q8K5B8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc12Q8K5B8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc12Q8K5B8 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc12Q8K5B8 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc12Q8K5B8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc12Q8K5B8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc12Q8K5B8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc12Q8K5B8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc12Q8K5B8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc12Q8K5B8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc12Q8K5B8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc12Q8K5B8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc12Q8K5B8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc12Q8K5B8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc12Q8K5B8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc12Q8K5B8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc12Q8K5B8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc12Q8K5B8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc12Q8K5B8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc12Q8K5B8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc12Q8K5B8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc12Q8K5B8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc12Q8K5B8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc12Q8K5B8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc12Q8K5B8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc12Q8K5B8 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc12Q8K5B8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc12Q8K5B8 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc12Q8K5B8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc12Q8K5B8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc12Q8K5B8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc12Q8K5B8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc12Q8K5B8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc12Q8K5B8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc12Q8K5B8 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc12Q8K5B8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc12Q8K5B8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc12Q8K5B8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc12Q8K5B8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc12Q8K5B8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc12Q8K5B8 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc12Q8K5B8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc12Q8K5B8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms