Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3M1

Rdh16f2, Cis-retinol/3alpha hydroxysterol short-chain dehydrogenase-like protein, mousemouse

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f2Q8K3M1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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Rdh16f2Q8K3M1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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Rdh16f2Q8K3M1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rdh16f2Q8K3M1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rdh16f2Q8K3M1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rdh16f2Q8K3M1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rdh16f2Q8K3M1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rdh16f2Q8K3M1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rdh16f2Q8K3M1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rdh16f2Q8K3M1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rdh16f2Q8K3M1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rdh16f2Q8K3M1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rdh16f2Q8K3M1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rdh16f2Q8K3M1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rdh16f2Q8K3M1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rdh16f2Q8K3M1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
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