Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3J1

Ndufs8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufs8Q8K3J1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ndufs8Q8K3J1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndufs8Q8K3J1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndufs8Q8K3J1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndufs8Q8K3J1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndufs8Q8K3J1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndufs8Q8K3J1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndufs8Q8K3J1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndufs8Q8K3J1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndufs8Q8K3J1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndufs8Q8K3J1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndufs8Q8K3J1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndufs8Q8K3J1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndufs8Q8K3J1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndufs8Q8K3J1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndufs8Q8K3J1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndufs8Q8K3J1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndufs8Q8K3J1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndufs8Q8K3J1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndufs8Q8K3J1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndufs8Q8K3J1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndufs8Q8K3J1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndufs8Q8K3J1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndufs8Q8K3J1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndufs8Q8K3J1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndufs8Q8K3J1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndufs8Q8K3J1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndufs8Q8K3J1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndufs8Q8K3J1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndufs8Q8K3J1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndufs8Q8K3J1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndufs8Q8K3J1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndufs8Q8K3J1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndufs8Q8K3J1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndufs8Q8K3J1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndufs8Q8K3J1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndufs8Q8K3J1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndufs8Q8K3J1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndufs8Q8K3J1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndufs8Q8K3J1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndufs8Q8K3J1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndufs8Q8K3J1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndufs8Q8K3J1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndufs8Q8K3J1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndufs8Q8K3J1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndufs8Q8K3J1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndufs8Q8K3J1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndufs8Q8K3J1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndufs8Q8K3J1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndufs8Q8K3J1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndufs8Q8K3J1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndufs8Q8K3J1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndufs8Q8K3J1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndufs8Q8K3J1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndufs8Q8K3J1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndufs8Q8K3J1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndufs8Q8K3J1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndufs8Q8K3J1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufs8Q8K3J1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufs8Q8K3J1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufs8Q8K3J1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufs8Q8K3J1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufs8Q8K3J1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufs8Q8K3J1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufs8Q8K3J1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufs8Q8K3J1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufs8Q8K3J1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufs8Q8K3J1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufs8Q8K3J1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufs8Q8K3J1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufs8Q8K3J1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufs8Q8K3J1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufs8Q8K3J1 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ndufs8Q8K3J1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ndufs8Q8K3J1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ndufs8Q8K3J1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ndufs8Q8K3J1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ndufs8Q8K3J1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ndufs8Q8K3J1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ndufs8Q8K3J1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ndufs8Q8K3J1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ndufs8Q8K3J1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ndufs8Q8K3J1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ndufs8Q8K3J1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ndufs8Q8K3J1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ndufs8Q8K3J1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ndufs8Q8K3J1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ndufs8Q8K3J1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ndufs8Q8K3J1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ndufs8Q8K3J1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ndufs8Q8K3J1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ndufs8Q8K3J1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ndufs8Q8K3J1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ndufs8Q8K3J1 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ndufs8Q8K3J1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ndufs8Q8K3J1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ndufs8Q8K3J1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ndufs8Q8K3J1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ndufs8Q8K3J1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ndufs8Q8K3J1 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms