Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrtm1Q8K377 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrtm1Q8K377 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrtm1Q8K377 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrtm1Q8K377 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrtm1Q8K377 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrtm1Q8K377 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrtm1Q8K377 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrtm1Q8K377 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrtm1Q8K377 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrtm1Q8K377 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrtm1Q8K377 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrtm1Q8K377 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrtm1Q8K377 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrtm1Q8K377 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrtm1Q8K377 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrtm1Q8K377 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrtm1Q8K377 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrtm1Q8K377 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrtm1Q8K377 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrtm1Q8K377 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrtm1Q8K377 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrtm1Q8K377 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrtm1Q8K377 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrtm1Q8K377 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrtm1Q8K377 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrtm1Q8K377 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrtm1Q8K377 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrtm1Q8K377 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrtm1Q8K377 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrtm1Q8K377 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrtm1Q8K377 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrtm1Q8K377 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrtm1Q8K377 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrtm1Q8K377 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrtm1Q8K377 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrtm1Q8K377 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrtm1Q8K377 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrtm1Q8K377 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrtm1Q8K377 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrtm1Q8K377 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrtm1Q8K377 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrtm1Q8K377 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrtm1Q8K377 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrtm1Q8K377 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrtm1Q8K377 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrtm1Q8K377 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrtm1Q8K377 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrtm1Q8K377 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrtm1Q8K377 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrtm1Q8K377 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrtm1Q8K377 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrtm1Q8K377 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrtm1Q8K377 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrtm1Q8K377 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrtm1Q8K377 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrtm1Q8K377 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrtm1Q8K377 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrtm1Q8K377 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrtm1Q8K377 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrtm1Q8K377 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrtm1Q8K377 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrtm1Q8K377 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrtm1Q8K377 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrtm1Q8K377 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrtm1Q8K377 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrtm1Q8K377 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrtm1Q8K377 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrtm1Q8K377 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrtm1Q8K377 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrtm1Q8K377 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrtm1Q8K377 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lrrtm1Q8K377 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrtm1Q8K377 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrtm1Q8K377 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrtm1Q8K377 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrtm1Q8K377 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrtm1Q8K377 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrtm1Q8K377 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrtm1Q8K377 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrtm1Q8K377 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrtm1Q8K377 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrtm1Q8K377 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrtm1Q8K377 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrtm1Q8K377 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrtm1Q8K377 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrtm1Q8K377 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrtm1Q8K377 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrtm1Q8K377 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrtm1Q8K377 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrtm1Q8K377 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrtm1Q8K377 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrtm1Q8K377 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrtm1Q8K377 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrtm1Q8K377 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrtm1Q8K377 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrtm1Q8K377 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrtm1Q8K377 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrtm1Q8K377 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrtm1Q8K377 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms